用于甲基化450k分析的ChAMP Bioconductor包的champ.lasso出错

Question

我刚刚安装了ChAMP及其所有依赖性甲基化450k分析。

我正在尝试教程（http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/ChAMP/inst/doc/ChAMP.pdf），但收到了错误。

当运行Probe Lasso DMR Hunter时，我遇到“你已经找到4161个重要的MVP，BH调整的P值低于0.05 [.data.frame中的错误（dmr.beta.means，22：24，）：   选择了未定义的列“

该错误可以防止暂停分析，我无法复制上述教程中显示的内容。

我尝试卸载并重新安装ChAMP，但无济于事......

任何建议和见解将不胜感激！提前谢谢！

Answer 1

使用R 3.1.0，可以解决错误。