我的代码的目标是创建一个新的矩阵BySite
,哪些行是LOLZ
行的总和(我正在使用colSums()
),这些行在{{1}中相关}矩阵。因此,如果两个XY
行匹配,那么我希望新矩阵有一行,它对相关的行(根据XY
)XY
行求和。
LOLZ
BySite<-matrix(0,dim(unique(XY))[1],dim(LOLZ)[2]);
BySite[1,]<-LOLZ[1,];
for (i in 1:dim(unique(XY))[1]){
tree<-which(apply(XY, 1, function(x) all(x == unique(XY)[i,]))==TRUE)
if (length(tree)==1){
BySite[i,]<-LOLZ[tree,]
}
else {
BySite[i,]<-colSums(LOLZ[tree,])
}
cat(i," *sigh*")
}
是纬度和经度矩阵,因此可以使用:
XY
对于LOLZ
XY<-matrix(c(rep(c(55:74),100),rep(c(101:120),100)),2000,2)
我的代码有效,但速度很慢,正在寻找建议以加快速度。
答案 0 :(得分:2)
以下是使用较小数据集的尝试:
XY = cbind(rep(50:55, 3), rep(100:105, 3))
set.seed(007); LOLZ = matrix(sample(1:5, 18 * 5, T), 18, 5)
paste_XY = paste(XY[, 1], XY[, 2], sep = "; ") #or apply(XY, 1, paste, collapse = "; ")
ans = rowsum(LOLZ, paste_XY)
#after running your code to build "BySite"
sum(ans != BySite)
#[1] 0