我正在使用R studio的 GenABEL 包将Affymetrix基因分型控制台的输出转换为.tfam文件。到目前为止，这是我的代码：
rm(list = ls())
setwd("C:/U/Is/GD/Affymetrix")
library("GenABEL", lib.loc="C:/PROGRA~1/R/R-211~1.1-X/library")
read.table("Genotyping_results.txt", fill = TRUE)
convert.snp.affymetrix(dir = "C:/U/Is/GD/Affymetrix", map = "Genotyping_results.txt" , outfile ="Genotyping_results.tfam")
我收到以下错误： “系统错误（命令，实习生= T）：'找不到'。” 我对编程的理解有限，我发现很难理解错误或如何解决它。
非常感谢任何帮助
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您在注释中提到您正在使用Windows。 ls不是您操作系统上的命令。
ls是Linux和R中的命令。
有很多方法可以将该命令添加到Windows，例如Cygwin。