下面的代码给了我一个非常漂亮的小提琴图(和内部的boxplot)。
import numpy as np
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt
foo = np.random.rand(100)
sns.violinplot(foo)
plt.boxplot(foo)
plt.show()
到目前为止一切顺利。但是,当我查看foo
时,变量不包含任何负值。 seaborn
情节在这里似乎有误导性。正常的matplotlib箱图提供了更接近我期望的东西。
如何制作更合适的小提琴曲线(不显示假阴性值)?
答案 0 :(得分:13)
正如评论所指出的,这是高斯KDE背后假设的结果(我不确定我称之为"工件")。正如已经提到的,这有点不可避免,如果您的数据不符合这些假设,您可能最好只使用箱图,该箱图仅显示实际数据中存在的点。
然而,在你的回答中,你会问它是否适合"更严格",这可能意味着一些事情。
一个答案可能是改变平滑内核的带宽。你用bw
参数做到这一点,这实际上是一个比例因子;将使用的带宽为bw * data.std()
:
data = np.random.rand(100)
sns.violinplot(y=data, bw=.1)
另一个答案可能是在数据点的极端处截断小提琴。 KDE仍然 fit ,密度超出数据范围,但尾部不会显示。您可以使用cut
参数执行此操作,该参数指定超过应绘制密度的极值的带宽单位数。要截断,请将其设置为0:
sns.violinplot(y=data, cut=0)
顺便说一下,violinplot
的API在{0.6}中为going to change,我在这里使用的是开发版本,但bw
和cut
都是参数存在于当前发布的版本中,并且行为大致相同。