Question

我试图使用scipy中的odeint来解决二阶ODE问题。我遇到的问题是函数隐式地耦合到二阶项，如简化片段中所示（请忽略示例的假装物理）：

import numpy as np
from scipy.integrate import odeint

def integral(y,t,F_l,mass):
    dydt = np.zeros_like(y)
    x, v = y
    F_r =  (((1-a)/3)**2 + (2*(1+a)/3)**2) * v # 'a' implicit 
    a  = (F_l - F_r)/mass

    dydt = [v, a]
return dydt


y0 = [0,5]
time = np.linspace(0.,10.,21)
F_lon = 100.
mass = 1000.

dydt = odeint(integral, y0, time, args=(F_lon,mass))

在这种情况下，我意识到可以用代数方式求解隐式变量，但是在我的实际场景中，F_r和a的评估之间存在很多逻辑，而代数操作失败了。

我相信DAE可以使用MATLAB的ode15i函数来解决，但是如果可能的话，我试图避免这种情况。

我的问题是 - 有没有办法解决python中的隐式ODE函数（DAE）（最好是scipy）？是否有更好的方法来解决上述问题？

作为最后的手段，从上一个时间步骤传递a是可以接受的。我怎样才能在每个时间步之后将dydt[1]传递回函数？

Answer 1

很老，但值得更新，因此对于偶然发现此问题的任何人都可能有用。 python中目前有很少的软件包可以解决隐式ODE。 GEKKO（https://github.com/BYU-PRISM/GEKKO）是其中一个软件包，专门研究混合整数，非线性优化问题的动态优化，但也可以用作通用DAE求解器。

上述“假装物理学”问题可以在GEKKO中按以下方式解决。

m= GEKKO()
m.time = np.linspace(0,100,101)
F_l = m.Param(value=1000)
mass = m.Param(value =1000)
m.options.IMODE=4
m.options.NODES=3
F_r = m.Var(value=0)
x = m.Var(value=0)
v = m.Var(value=0,lb=0)
a = m.Var(value=5,lb=0)
m.Equation(x.dt() == v)
m.Equation(v.dt() == a)
m.Equation (F_r ==  (((1-a)/3)**2 + (2*(1+a)/3)**2 * v)) 
m.Equation (a == (1000 - F_l)/mass)
m.solve(disp=False)
plt.plot(x)

Answer 2

如果代数操作失败，你可以找到约束的数值解，例如在每个时间步运行fsolve：

import sys
from numpy import linspace
from scipy.integrate import odeint
from scipy.optimize import fsolve

y0 = [0, 5]
time = linspace(0., 10., 1000)
F_lon = 10.
mass = 1000.

def F_r(a, v):
    return (((1 - a) / 3) ** 2 + (2 * (1 + a) / 3) ** 2) * v

def constraint(a, v):
    return (F_lon - F_r(a, v)) / mass - a

def integral(y, _):
    v = y[1]
    a, _, ier, mesg = fsolve(constraint, 0, args=[v, ], full_output=True)
    if ier != 1:
        print "I coudn't solve the algebraic constraint, error:\n\n", mesg
        sys.stdout.flush()
    return [v, a]

dydt = odeint(integral, y0, time)

显然，这会减慢你的时间整合。始终检查fsolve是否找到了一个好的解决方案，然后刷新输出，以便在发生时实现它并停止模拟。

关于如何＆＃34;缓存＆＃34;在前一个时间步的变量值，您可以利用默认参数仅在函数定义中计算的事实，

from numpy import linspace
from scipy.integrate import odeint

#you can choose a better guess using fsolve instead of 0
def integral(y, _, F_l, M, cache=[0]):
    v, preva = y[1], cache[0]
    #use value for 'a' from the previous timestep
    F_r = (((1 - preva) / 3) ** 2 + (2 * (1 + preva) / 3) ** 2) * v 
    #calculate the new value
    a = (F_l - F_r) / M
    cache[0] = a
    return [v, a]

y0 = [0, 5]
time = linspace(0., 10., 1000)
F_lon = 100.
mass = 1000.

dydt = odeint(integral, y0, time, args=(F_lon, mass))

请注意，为了使技巧起作用，cache参数必须是可变的，这就是我使用列表的原因。如果您不熟悉默认参数的工作原理，请参阅this链接。

请注意，这两个代码不会产生相同的结果，您应该非常小心地使用前一个时间步的值，以确保数值稳定性和精度。第二个显然要快得多。

求解隐式ODE（微分代数方程DAE）

2 个答案: