我想运行逻辑回归的因变量(在我的数据集中它是:dat$admit
)包含所有可用变量,每个回归都有自己的独立变量和因变量。我想回来的结果是每个回归总结的列表:coeff,p-value,AUC。使用下面提交的数据集应该有3个回归。
以下是一个示例数据集(其中admit是逻辑回归因变量):
>dat <- read.table(text = " female apcalc admit num
+ 0 0 0 7
+ 0 0 1 1
+ 0 1 0 3
+ 0 1 1 7
+ 1 0 0 5
+ 1 0 1 1
+ 1 1 0 0
+ 1 1 1 6",
+ header = TRUE)
我有这个函数,它提供了每个回归和coef的列表,但是我找不到绑定AUC和p值的方法。 这是代码:
t(sapply(setdiff(names(dat),"admit"), function(x) coef(glm(reformulate(x,response="admit"), data=dat,family=binomial))))
知道如何创建此列表吗? 谢谢, 罗恩
答案 0 :(得分:2)
尝试
library(caTools)
ResFunc <- function(x) {
temp <- glm(reformulate(x,response="admit"), data=dat,family=binomial)
c(summary(temp)$coefficients[,1],
summary(temp)$coefficients[,4],
colAUC(predict(temp, type = "response"), dat$admit))
}
temp <- as.data.frame(t(sapply(setdiff(names(dat),"admit"), ResFunc)))
colnames(temp) <- c("Intercept", "Estimate", "P-Value (Intercept)", "P-Value (Estimate)", "AUC")
temp
# Intercept Estimate P-Value (Intercept) P-Value (Estimate) AUC
# female 0.000000e+00 0.000000e+00 1 1 0.5
# apcalc 0.000000e+00 0.000000e+00 1 1 0.5
# num 5.177403e-16 -1.171295e-16 1 1 0.5