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我有扩展名为.CEL的原始微阵列表达式数据文件,但是对于少数文件,扩展名是某种\ .CEL(即名称空间点CEL)。我已经制作了一个简单的shell脚本,可以在ubuntu终端上正确替换文件名,但我不知道在R环境中使用它。我甚至尝试使用system()命令来执行shell脚本,但是对我来说不起作用。
system()
我编写的Shell脚本如下:
for file in *.CEL; do mv "$file" "${file//[[:space:]]}"; done