如何从R环境运行shell脚本

时间:2014-03-11 10:10:43

标签: r

我有扩展名为.CEL的原始微阵列表达式数据文件,但是对于少数文件,扩展名是某种\ .CEL(即名称空间点CEL)。我已经制作了一个简单的shell脚本,可以在ubuntu终端上正确替换文件名,但我不知道在R环境中使用它。我甚至尝试使用system()命令来执行shell脚本,但是对我来说不起作用。

我编写的Shell脚本如下:

for file in *.CEL; 
do mv "$file" "${file//[[:space:]]}";
done

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