如何告诉mex链接到/ usr / lib中的libstdc ++。so.6而不是MATLAB目录中的那个?

时间:2012-03-31 20:15:55

标签: linux matlab linker mex

现在mex in MATLAB 2012a只正式支持gcc 4.4.6,但我想使用gcc 4.7,风险自负。现在如果我直接用mex编译一些东西,它会抱怨

/usr/lib/gcc/i686-linux-gnu/4.7/cc1plus:
/usr/local/MATLAB/R2012a/sys/os/glnx86/libstdc++.so.6:
version `GLIBCXX_3.4.15' not found
(required by /usr/lib/i386-linux-gnu/libppl_c.so.4)

/usr/lib/gcc/i686-linux-gnu/4.7/cc1plus:
/usr/local/MATLAB/R2012a/sys/os/glnx86/libstdc++.so.6:
version `GLIBCXX_3.4.15' not found
(required by /usr/lib/i386-linux-gnu/libppl.so.9)

strings /usr/lib/i386-linux-gnu/libstdc++.so.6 | grep 'GLIBCXX'我确认此libstdc++.so.6具有该版本字符串。我查看了mexopts.sh并修改了该脚本中的变量$RPATH$MLIBS,但它不起作用。因此,如果我不使用符号链接,我在哪里可以配置mex使用的libstdc++.so.6的路径?谢谢。

8 个答案:

答案 0 :(得分:12)

  

/usr/lib/gcc/i686-linux-gnu/4.7/cc1plus:/usr/local/MATLAB/R2012a/sys/os/glnx86/libstdc++.so.6:找不到版本`GLIBCXX_3.4.15' / p>

问题在于,当您使用mex进行构建时,会将-L/usr/local/MATLAB/R2012a/sys/os/glnx86放在链接行上,因此链接器会从那里选择libstdc++.so

如果您无法先说服mex先加-L/usr/lib/i386-linux-gnu,那么我认为您唯一的另一个选择就是删除/usr/local/MATLAB/R2012a/sys/os/glnx86/libstdc++.so(只需将其重命名为libstdc++.so.bak

答案 1 :(得分:10)

您需要创建一个指向gcc 4.7库的符号链接,以便matlab知道如何使用它。类似的东西:

ln -s {/path/to/file-name} {link-name}

如果您不想使用符号链接,那么只需在启动matlab的终端中定义此路径:

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/path/to/libstdc++.so.6
./matlab

答案 2 :(得分:8)

这是一个迟到的答案,但我相信最干净,最受Mathworks认可且侵入性最小的解决方案是编辑.matlab7rc.sh脚本。这是在类UNIX系统下启动MATLAB时matlab脚本使用的脚本。 (见http://www.mathworks.ch/ch/help/matlab/ref/matlabunix.html

将该脚本(在{matlabroot}/bin下找到)复制到项目的根目录或主目录。然后告诉MATLAB首先在系统目录中搜索C ++库,而不是它自己的目录。在我的系统上,我更改了第191行:

191c191
<       LDPATH_PREFIX='/usr/lib/x86_64-linux-gnu'
---
>       LDPATH_PREFIX=''

(简单地将LD_LIBRARY_PATH设置为空字符串不是一个好的解决方案,因为这会阻止您加载其他第三方库。)

完成此操作后,您可能会在运行mex时收到以下消息:

/usr/bin/ld: cannot find -lstdc++

这通常意味着未安装g++。在类似Debian的系统上,运行:

sudo apt-get install g++

从现在开始,你可能仍会收到一个令人讨厌的警告,即使用超出官方支持的版本的gcc,但这是无害的,可以忽略。

答案 3 :(得分:2)

我尝试了两个答案..但没有一个对我有用。

然而这对我有用。在matlab中运行这个 -

setenv('LD_LIBRARY_PATH', '');

只针对遇到同样问题的人。

P.S:我找到了这个解决方案here

答案 4 :(得分:2)

您可以通过在glnx86部分添加一行来修改~/.matlab/R2012a/mexopts.sh后生成的mex -setup

LD_LIBRARY_PATH='/usr/lib:$LD_LIBRARY_PATH'

或在glnx64中:

LD_LIBRARY_PATH='/usr/lib64:$LD_LIBRARY_PATH'

答案 5 :(得分:0)

我无法找到libstdc ++。so.6的位置,所以我无法完全测试geek_girl给出的解决方案。然而,对th1rdey3的修改起了作用。我跑进了matlab控制台:

setenv('LD_LIBRARY_PATH', 'usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server:/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64:/usr/local/MATLAB/R2011a/bin/glnxa64:/usr/lib/boost_1_54_0/libs/regex/build/gcc');

这是我用于&#39; LD_LIBRARY_PATH&#39;的值。在Eclipse中编译我的C ++代码时(我不使用mex文件,而是在Eclipse中创建我的C ++代码的可执行文件,然后从matlab shell运行它)。在我的例子中,&#39; LD_LIBRARY_PATH&#39;这很长,因为我的C ++代码使用boost的正则表达式,matlab库(libmat,libmx等),GSL库和Armadillo。如果你不使用所有这些库,我猜setenv(&#39; LD_LIBRARY_PATH&#39;&#39;&#39;)就足够了。

答案 6 :(得分:0)

在Matlab R2015b上,我首先重新链接libstdc++.so.6,然后按照@lindelof的描述编辑.matlab7rc.sh。在我的桌面上,从终端:

locate libstdc++.so.6

就我而言,系统库位于/usr/lib64。然后

cd /usr/local/matlab/sys/os/glnxa64
mv libstdc++.so.6 libstdc++.so.6.bak
ln -s /usr/lib64/libstc++.so.6 libstc++.so.6
cd /usr/local/src/matlab/bin/glnxa64/
mv libstdc++.so.6 libstdc++.so.6.bak
ln -s /usr/lib64/libstc++.so.6 libstc++.so.6

然后在.matlab7rc.sh中修改{matlabroot}/bin。在同一目录中删除任何mexopts.sh文件。重启Matlab。从头开始MEX您的文件(这将使用新设置构建一个新的mexopts.sh文件。从Matlab控制台运行它。

答案 7 :(得分:0)

如果您没有root访问权限,那么您可以尝试,
LD_PRELOAD='path/to/libstdc++.so.6.0.21' matlab