Question

我有一个简单的问题。

我最近尝试使用我学校的服务器运行mpi程序，并遇到以下“奇怪”问题：

为了执行'mpirun'命令，我必须将其路径放入我在.bashrc中的默认路径，然后输入：

mpirun -n 16 ./myprogram

只是为了得到一个名为：libmpi.so.0

的缺失库的错误

但是，如果我尝试使用如下所示的完整mpirun路径运行程序

/usr/lib64/openmpi/bin/mpirun -n 16 ./myprogram

一切都很好。

我检查了openmpi的FAQ，它说我需要将以下行放入我的.bashrc

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/openmpi/lib

这对我来说实际上是固定的，但我的问题仍未得到解决：

为什么会这样？

提前感谢您的时间。

Answer 1

因为Open MPI的包装编译器在编译/链接myprogram时不会自动-rpath libmpi.so所在位置（我们在OMPI包装器编译器中传递的标志中采用极简主义方法 - 如果它们'不是需要，我们不会把它们放在那里。）

具体来说，当您在Linux中运行可执行文件时，运行时链接程序将查找该可执行文件所需的所有库（运行“ldd myprogram”，您将看到所需库的列表为myprogram）。它将查看所有系统默认位置（它们本身可由sysadmins配置）。它还会查看LD_LIBRARY_PATH指定的所有目录 - LD_LIBRARY_PATH实际上是扩展目录列表的每用户方法，以便链接器搜索以查找共享库。

我猜测libmpi.so不在任何系统默认位置，因此您需要在LD_LIBRARY_PATH中指定其目录。

或者，您可以在链接myprogram时添加-rpath子句。例如：

mpicc myprogram.c -o myprogram -Wl,-rpath /opt/openmpi/lib

这会将位置/ opt / openmpi / lib嵌入到myprogram二进制文件本身，链接器也会在libmpi.so（以及任何其他需要解析的库）的位置查找。例如：

# Without an rpath clause:
[8:45] svbu-mpi:~/mpi % mpicc hello.c -o hello
[8:45] svbu-mpi:~/mpi % ldd hello
linux-vdso.so.1 =>  (0x00007ffff7ffe000)
libmpi.so.0 => not found
libdl.so.2 => /lib64/libdl.so.2 (0x0000003d58c00000)
libm.so.6 => /lib64/libm.so.6 (0x0000003d59c00000)
libnuma.so.1 => /usr/lib64/libnuma.so.1 (0x00007ffff7ddf000)
libpci.so.3 => /lib64/libpci.so.3 (0x00007ffff7bd2000)
librt.so.1 => /lib64/librt.so.1 (0x0000003d5a000000)
libnsl.so.1 => /lib64/libnsl.so.1 (0x0000003d5c000000)
libutil.so.1 => /lib64/libutil.so.1 (0x0000003d5a800000)
libpthread.so.0 => /lib64/libpthread.so.0 (0x0000003d59400000)
libc.so.6 => /lib64/libc.so.6 (0x0000003d59000000)
/lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x0000003d58800000)
libresolv.so.2 => /lib64/libresolv.so.2 (0x0000003d5b000000)

注意libmpi.so条目中的“not found”。

您可以设置LD_LIBRARY_PATH并找到它：

[8:45] svbu-mpi:~/mpi % setenv LD_LIBRARY_PATH /home/jsquyres/bogus/lib
[8:45] svbu-mpi:~/mpi % ldd hello
linux-vdso.so.1 =>  (0x00007ffff7ffe000)
libmpi.so.0 => /home/jsquyres/bogus/lib/libmpi.so.0 (0x00007ffff7b06000)
libdl.so.2 => /lib64/libdl.so.2 (0x0000003d58c00000)
libm.so.6 => /lib64/libm.so.6 (0x0000003d59c00000)
libnuma.so.1 => /usr/lib64/libnuma.so.1 (0x00007ffff78e8000)
libpci.so.3 => /lib64/libpci.so.3 (0x00007ffff76db000)
librt.so.1 => /lib64/librt.so.1 (0x0000003d5a000000)
libnsl.so.1 => /lib64/libnsl.so.1 (0x0000003d5c000000)
libutil.so.1 => /lib64/libutil.so.1 (0x0000003d5a800000)
libpthread.so.0 => /lib64/libpthread.so.0 (0x0000003d59400000)
libc.so.6 => /lib64/libc.so.6 (0x0000003d59000000)
/lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x0000003d58800000)
libresolv.so.2 => /lib64/libresolv.so.2 (0x0000003d5b000000)

或者您可以使用-rpath子句（然后LD_LIBRARY_PATH中的设置变得无关紧要）：

[8:45] svbu-mpi:~/mpi % mpicc hello.c -o hello -Wl,-rpath /home/jsquyres/bogus/lib
[8:45] svbu-mpi:~/mpi % ldd hello
linux-vdso.so.1 =>  (0x00007ffff7ffe000)
libmpi.so.0 => /home/jsquyres/bogus/lib/libmpi.so.0 (0x00007ffff7b06000)
libdl.so.2 => /lib64/libdl.so.2 (0x0000003d58c00000)
libm.so.6 => /lib64/libm.so.6 (0x0000003d59c00000)
libnuma.so.1 => /usr/lib64/libnuma.so.1 (0x00007ffff78e8000)
libpci.so.3 => /lib64/libpci.so.3 (0x00007ffff76db000)
librt.so.1 => /lib64/librt.so.1 (0x0000003d5a000000)
libnsl.so.1 => /lib64/libnsl.so.1 (0x0000003d5c000000)
libutil.so.1 => /lib64/libutil.so.1 (0x0000003d5a800000)
libpthread.so.0 => /lib64/libpthread.so.0 (0x0000003d59400000)
libc.so.6 => /lib64/libc.so.6 (0x0000003d59000000)
/lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x0000003d58800000)
libresolv.so.2 => /lib64/libresolv.so.2 (0x0000003d5b000000)

mpirun命令显示bash中的奇怪行为

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