RMySQL，获取错误 - RS-DBI驱动程序警告:(获取行时出错）

Question

我正在使用RMySQL从数据表中获取一些行（表格很大，所以我不能在这里发布，但基本上包含一堆数字..总共10列和大约12,000行）。运行fetch(con, n=-1)时出现以下错误： RS-DBI driver warning: (error while fetching rows)，服务器只返回1713行。

如果我删除了一些被提取的列，那么这似乎工作正常。有谁知道这可能与什么有关？我甚至不知道从哪里开始调试。这可能是服务器端设置吗？我的R会话有足够的内存（20演出）。

Answer 1

每列是数字还是数字列表？也就是说，每列中有多少字节？

我之前遇到过这个问题，当我遇到它时，这是因为我试图过快地提取太多数据。我发现在这些情况下，使用较小的n值进行多次调用有时可以正常工作。然后，我遇到麻烦的数据库中的行已经很大了

Answer 2

一个更好的解决方案是代替n = -1尝试输入一个非常大的数字，如n = 1000000。我使用它之后没有出现错误。在我的例子中，我获取的行数是1.13百万

Answer 3

我遇到了同样的问题：

1. 获取所有行一次：

   df = dbFetch(res, n = -1)

   =＆GT;它只返回结果集的一部分，并停止获取更多行。

2. 使用循环来获取块：

   while (!dbHasCompleted(res)) {
       chunk = dbFetch(res, n = 1000)
       print(nrow(chunk))
       df = rbind(df, chunk)
   }
   

   =＆GT;它返回了一段时间，然后进入无限循环的零大小的块（打印＆＃34; [1] 0＆＃34;永远），即使结果集尚未完成以获取所有行：{{ 1}}。

然后，我使用了这个策略：

使用＆＃34; dbHasCompleted(res) == FALSE＆＃34;运行查询捕获结果集的大小。在行计数[select count(1) from table where ...]中添加1并使用此＆＃34; count + 1＆＃34;作为row_count = as.integer(dbFetch(res, n = 1)) + 1参数，在下一个查询中一次获取所有行。到目前为止似乎没问题......但后来我知道了这种形式：

n

更好的方法，还没有发现错误。