Question

我在biotoolbox包中运行了一个perl脚本。（http://code.google.com/p/biotoolbox/）但得到了与jarfile相关的错误消息。

$./bar2wig.pl

 This program will convert bar files to a wig file
 Usage:
 bar2wig.pl [--options...] <filename>

  Options:
  --in <filename> or <directory>
  --out <filename> 

$  ./bar2wig.pl --in  /Users/biotoolbox/scripts/ --out example

This program will convert bar files to a wig file
checking input file(s)....
converting to gr files...
Unable to access jarfile /usr/local/USeq/Apps/Bar2Gr
writing wig file...
cleaning up temp files... done

我不知道如何处理错误：无法访问jarfile。它看起来像java相关的错误，虽然这个脚本是perl。

对此有何评论？

Answer 1

是的，很明显它找不到jarfile。阅读jar上的Wiki条目，但足以说它只是一个可移植的java文件包。

您将需要下载该jar文件并定义它在配置文件中的位置biotoolbox.cfg

无法访问jarfile

1 个答案: