我整个星期都在努力尝试让3机群运行扭矩+ mpich2。我的计划是将它用作我的开发环境,并最终在EC2或其他云中运行生产代码。由于它是一个开发环境,我只是使用一些备用机器(2个64位,1个32位,以防万一)。这些机器正在使用Ubuntu的各种发行版(特立独行,耐寒和业力)。
我遇到的问题是,在一个简单的发送/接收测试程序中,我使recv调用看起来内存不足,我不明白为什么。机器上有大约1.2G的RAM,发送/接收1个int。
下面是代码:
/*
* A very simple send/recv program
*/
#include <stdlib.h>
#include <unistd.h>
#include <stdio.h>
#include <mpi.h>
#define MAXHOSTNAMELEN 64
int main(int argc, char **argv)
{
int pid, from;
int nproc;
MPI_Status status;
int to_recv;
int to_send = 1;
char hostname[MAXHOSTNAMELEN];
MPI_Init(&argc, &argv);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &nproc);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &pid);
gethostname(hostname, MAXHOSTNAMELEN);
printf("%d of %d:%s Checking in\n", pid, nproc, hostname);
if (pid == 0) {
MPI_Recv(&to_recv, 1, MPI_INT, 2, 0, MPI_COMM_WORLD, &status);
from = status.MPI_SOURCE;
printf("%d of %d:%s Recieved Value %d from %d\n", pid, nproc, hostname, to_recv, from);
MPI_Recv(&to_recv, 1, MPI_INT, 1, 0, MPI_COMM_WORLD, &status);
from = status.MPI_SOURCE;
printf("%d of %d:%s Recieved Value %d from %d\n", pid, nproc, hostname, to_recv, from);
} else {
MPI_Send(&to_send, 1, MPI_INT, 0, 0, MPI_COMM_WORLD);
printf("%d of %d:%s Sent value\n", pid, nproc, hostname);
}
MPI_Finalize();
exit(0);
}
这是输出:
0 of 3:master Checking in
2 of 3:node1 Checking in
1 of 3:node2 Checking in
1 of 3:node2 Sent value
Fatal error in MPI_Recv: Other MPI error, error stack:
MPI_Recv(186)...........................: MPI_Recv(buf=0x7fff33bed040, count=1, MPI_INT, src=2, tag=0, MPI_COMM_WORLD, status=0x7fff33bed020) failed
MPIDI_CH3I_Progress(402)................:
MPID_nem_mpich2_blocking_recv(905)......:
MPID_nem_tcp_connpoll(1838).............:
state_commrdy_handler(1676).............:
MPID_nem_tcp_recv_handler(1564).........:
MPID_nem_handle_pkt(636)................:
MPIDI_CH3_PktHandler_EagerShortSend(441): Out of memory
Fatal error in MPI_Send: Other MPI error, error stack:
MPI_Send(173)..............: MPI_Send(buf=0x7fff8ee5396c, count=1, MPI_INT, dest=0, tag=0, MPI_COMM_WORLD) failed
MPID_nem_tcp_connpoll(1826): Communication error with rank 0: Connection refused
如果有任何我没有提供的必要信息,请告诉我,我会添加。
MPICH2版本:mpich2-1.4.1p1从每台机器的源代码编译而来
gcc版本:
主人:4.2.4
node1:4.4.5
node2:4.4.1
另外,如果重要,node2是32位机器。提前感谢您的帮助。
编辑:我在过去使用过的集群上运行了这个集群,该集群已经设置并且已知可以正常工作以测试代码。代码似乎工作正常,我相信我看到的问题与我的开发群集上的MPI配置有关。
答案 0 :(得分:3)
不幸的是,MPICH2不支持异构平台。您可以构建MPICH2和32位应用程序,并在所有计算机上运行它。