Question

我正在尝试使用R制作矢量的直方图。当我绘制这个时，x轴从5到9但是直方图的一部分在5之前（最低的数字是4.414002），其中一部分是在我的y轴上也是如此，它从0-5000开始，但是高度'stave'比这5000更高。

为什么它不从向量中的最低值开始？请注意，它只是不够长的条形图，图形尺寸合适（所以它不是mar或oma设置的问题，我尝试改变那些但是没有帮助）

以下是我的代码

import rpy2.robjects as R
import R_functions as R_funct


csvData = (R.r['read.csv'](file='/homes/ndeklein/test.csv', head=True, sep='\t'))

hist = R.r.hist
R.r.png('/homes/ndeklein/test_intensity_hist.png', width=300, height=300)
intensityVector = csvData[0]
logIntensityVector = R.r['log10'](intensityVector)

hist(logIntensityVector, main='Intensity per feature histogram', xlab='logged intensity', ylab='frequencies of features', br=20)

R.r['dev.off']()

编辑：

我发现问题是什么，在R代码中它看起来像这样：

vector = c(5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 6.7399637450174, 6.7399637450174, 6.7399637450174, 6.7399637450174, 6.7399637450174, 6.7399637450174, 6.7399637450174, 6.7399637450174)
hist(vector, breaks=20)

但是因为范围在4-9之间（在这个例子中很少，所以），有20次休息太多了。将休息放在6可以解决问题。

Answer 1

将休息放在较低的数字上（在我的例子中为br = 6）

hist(logIntensityVector, main='Intensity per feature histogram', xlab='logged intensity', ylab='frequencies of features', br=6)

解决了这个问题。

为什么我的绘图的x轴从5开始而不是在向量的最低点？

1 个答案: