为什么在C ++中读取stdin的行比Python要慢得多?

时间:2012-02-21 02:17:50

标签: python c++ benchmarking iostream getline

我想比较使用Python和C ++从stdin读取字符串的读取行,并且看到我的C ++代码比同等的Python代码运行慢了一个数量级,这让我很震惊。由于我的C ++生锈了,我还不是专家Pythonista,请告诉我,如果我做错了什么或者我是否误解了什么。


(TLDR回答:包含声明:cin.sync_with_stdio(false)或仅使用fgets

TLDR结果:一直向下滚动到我的问题的底部并查看表格。)


C ++代码:

#include <iostream>
#include <time.h>

using namespace std;

int main() {
    string input_line;
    long line_count = 0;
    time_t start = time(NULL);
    int sec;
    int lps;

    while (cin) {
        getline(cin, input_line);
        if (!cin.eof())
            line_count++;
    };

    sec = (int) time(NULL) - start;
    cerr << "Read " << line_count << " lines in " << sec << " seconds.";
    if (sec > 0) {
        lps = line_count / sec;
        cerr << " LPS: " << lps << endl;
    } else
        cerr << endl;
    return 0;
}

// Compiled with:
// g++ -O3 -o readline_test_cpp foo.cpp

Python等效:

#!/usr/bin/env python
import time
import sys

count = 0
start = time.time()

for line in  sys.stdin:
    count += 1

delta_sec = int(time.time() - start_time)
if delta_sec >= 0:
    lines_per_sec = int(round(count/delta_sec))
    print("Read {0} lines in {1} seconds. LPS: {2}".format(count, delta_sec,
       lines_per_sec))

以下是我的结果:

$ cat test_lines | ./readline_test_cpp
Read 5570000 lines in 9 seconds. LPS: 618889

$cat test_lines | ./readline_test.py
Read 5570000 lines in 1 seconds. LPS: 5570000

我应该注意到我在Mac OS X v10.6.8(Snow Leopard)和Linux 2.6.32(Red Hat Linux 6.2)下都试过这个。前者是MacBook Pro,后者是一个非常强大的服务器,而不是太过贴切。

$ for i in {1..5}; do echo "Test run $i at `date`"; echo -n "CPP:"; cat test_lines | ./readline_test_cpp ; echo -n "Python:"; cat test_lines | ./readline_test.py ; done
Test run 1 at Mon Feb 20 21:29:28 EST 2012
CPP:   Read 5570001 lines in 9 seconds. LPS: 618889
Python:Read 5570000 lines in 1 seconds. LPS: 5570000
Test run 2 at Mon Feb 20 21:29:39 EST 2012
CPP:   Read 5570001 lines in 9 seconds. LPS: 618889
Python:Read 5570000 lines in 1 seconds. LPS: 5570000
Test run 3 at Mon Feb 20 21:29:50 EST 2012
CPP:   Read 5570001 lines in 9 seconds. LPS: 618889
Python:Read 5570000 lines in 1 seconds. LPS: 5570000
Test run 4 at Mon Feb 20 21:30:01 EST 2012
CPP:   Read 5570001 lines in 9 seconds. LPS: 618889
Python:Read 5570000 lines in 1 seconds. LPS: 5570000
Test run 5 at Mon Feb 20 21:30:11 EST 2012
CPP:   Read 5570001 lines in 10 seconds. LPS: 557000
Python:Read 5570000 lines in  1 seconds. LPS: 5570000

微小的基准附录和回顾

为了完整起见,我想我会使用原始(同步)C ++代码在同一个盒子上更新同一文件的读取速度。同样,这是针对快速磁盘上的100M线路文件。这是比较,有几种解决方案/方法:

Implementation      Lines per second
python (default)           3,571,428
cin (default/naive)          819,672
cin (no sync)             12,500,000
fgets                     14,285,714
wc (not fair comparison)  54,644,808

10 个答案:

答案 0 :(得分:1489)

默认情况下,cin与stdio同步,这会导致它避免任何输入缓冲。如果将其添加到主页的顶部,您应该会看到更好的性能:

std::ios_base::sync_with_stdio(false);

通常,当缓冲输入流时,不是一次读取一个字符,而是以更大的块读取流。这减少了系统调用的数量,这通常相对昂贵。但是,由于基于FILE*的{​​{1}}和stdio通常具有单独的实现,因此具有单独的缓冲区,如果两者一起使用,则可能会导致问题。例如:

iostreams

如果int myvalue1; cin >> myvalue1; int myvalue2; scanf("%d",&myvalue2); 读取的输入多于实际需要的输入,则第二个整数值将不可用于cin函数,该函数具有自己的独立缓冲区。这会导致意想不到的结果。

为避免这种情况,默认情况下,流与scanf同步。实现此目的的一种常见方法是使用stdio函数根据需要cin一次读取每个字符。不幸的是,这引入了很多开销。对于少量输入,这不是一个大问题,但是当你阅读数百万行时,性能损失是显着的。

幸运的是,图书馆设计师决定,如果您知道自己在做什么,也应该能够禁用此功能以提高性能,因此他们提供了sync_with_stdio方法。

答案 1 :(得分:149)

出于好奇,我已经了解了幕后发生的事情,并且我在每次测试中都使用了dtruss/strace

C ++

./a.out < in
Saw 6512403 lines in 8 seconds.  Crunch speed: 814050

系统调用sudo dtruss -c ./a.out < in

CALL                                        COUNT
__mac_syscall                                   1
<snip>
open                                            6
pread                                           8
mprotect                                       17
mmap                                           22
stat64                                         30
read_nocancel                               25958

的Python

./a.py < in
Read 6512402 lines in 1 seconds. LPS: 6512402

系统调用sudo dtruss -c ./a.py < in

CALL                                        COUNT
__mac_syscall                                   1
<snip>
open                                            5
pread                                           8
mprotect                                       17
mmap                                           21
stat64                                         29

答案 2 :(得分:122)

我在这里落后了几年,但是:

编辑4/5/6&#39;原帖子,你正在使用的结构:

$ /usr/bin/time cat big_file | program_to_benchmark

这有两种不同的方式:

  1. 你实际上是在执行'cat`,而不是你的基准。用户&#39;和&#39; sys&#39; `time`显示的CPU使用率是`cat`,而不是基准程序。更糟糕的是,真实的&#39;时间也不一定准确。根据本地操作系统中“cat”和管道的实现,“cat”可能会写入最终的巨型缓冲区,并在读者进程完成其工作之前很久就会退出。

  2. 使用“猫”是不必要的,实际上适得其反;你正在添加移动部件。如果你使用的是一个足够旧的系统(即使用单个CPU并且 - 在某些代码的计算机中 - I / O比CPU快) - “cat”运行这一事实可能会对结果产生很大的影响。你也受到任何输入和输出缓冲以及其他处理`cat`的影响。 (如果我是Randal Schwartz,这可能会获得'Useless Use Of Cat'奖励。

  3. 更好的结构将是:

    $ /usr/bin/time program_to_benchmark < big_file
    

    在这个语句中,它是 shell ,它打开big_file,将它传递给你的程序(好吧,实际上是`time`然后将你的程序作为子进程执行)作为已经打开的文件描述符。 100%的文件阅读完全是您尝试进行基准测试的程序的责任。这可以让您真正了解其性能,而不会出现虚假的并发症。

    我会提到两种可能的,但实际上是错误的,修复&#39;这也可以考虑(但是我的数字不同,因为这些不是原帖中的错误):

    一个。你可以修复&#39;这只计划您的计划:

    $ cat big_file | /usr/bin/time program_to_benchmark
    

    B中。或者通过计时整个管道:

    $ /usr/bin/time sh -c 'cat big_file | program_to_benchmark'
    

    出于与#2相同的原因,这些是错误的:他们仍然不必要地使用`cat`。我提到它们有几个原因:

    • 他们更自然&#39;对于那些对POSIX shell的I / O重定向工具不太满意的人来说

    • 可能存在需要`cat` 的情况(例如:要读取的文件需要某种权限才能访问,并且您不希望将该权限授予程序进行基准测试:`sudo cat / dev / sda | / usr / bin / time my_compression_test --no-output`)

    • 在实践中,在现代机器上,管道中添加的“cat”可能没有实际意义

    但我最后还是犹豫了一下。如果我们检查编辑5&#39;中的最后一个结果。 -

    $ /usr/bin/time cat temp_big_file | wc -l
    0.01user 1.34system 0:01.83elapsed 74%CPU ...
    

    - 这声称`cat`在测试期间消耗了74%的CPU;实际上1.34 / 1.83约为74%。也许是一阵:

    $ /usr/bin/time wc -l < temp_big_file
    

    只剩下.49秒!可能不是:“cat”在这里必须支付read()系统调用(或等效的),这些调用从“磁盘”传输文件。 (实际上是缓冲区缓存),以及管道写入将它们传递给`wc`。正确的测试仍然必须进行read()调用;只保存了write-to-pipe和read-from-pipe调用,这些调用应该相当便宜。

    不过,我预测你可以衡量`cat file |之间的区别wc -l`和`wc -l&lt; file`并找到一个明显的(2位数百分比)差异。每个较慢的测试都会在绝对时间内付出类似的代价;然而,这相当于其较长总时间的一小部分。

    事实上,我在Linux 3.13(Ubuntu 14.04)系统上使用1.5千兆字节的垃圾文件做了一些快速测试,获得了这些结果(这些实际上是3&#39;最好的3&#39;结果;启动之后缓存,当然):

    $ time wc -l < /tmp/junk
    real 0.280s user 0.156s sys 0.124s (total cpu 0.280s)
    $ time cat /tmp/junk | wc -l
    real 0.407s user 0.157s sys 0.618s (total cpu 0.775s)
    $ time sh -c 'cat /tmp/junk | wc -l'
    real 0.411s user 0.118s sys 0.660s (total cpu 0.778s)
    

    请注意,两个管道结果声称占用的CPU时间(用户+ sys)比实时多。这是因为我使用了shell(Bash)内置的&#39; time&#39;命令,认识到管道;我在一台多核机器上,管道中的单独进程可以使用单独的内核,比实时更快地累积CPU时间。使用/ usr / bin / time我看到比实时更小的CPU时间 - 表明它只能在命令行上传递给它的单个管道元素。此外,shell的输出给出了毫秒,而/ usr / bin / time只给出了一秒钟的hundreth。

    因此,在`wc -l`的效率级别,`cat`产生了巨大的差异:409/283 = 1.453或45.3%更多实时,775/280 = 2.768,或者使用的CPU高出177% !在我随机的那个时候就是那里的测试盒。

    我应该补充一点,这些测试方式之间至少还有一个显着的区别,我不能说它是好处还是错误;你必须自己决定:

    当你运行`cat big_file |时/ usr / bin / time my_program`,你的程序正在接收来自管道的输入,正好是'cat`发送的速度,以及不大于`cat`所写的块。

    运行`/ usr / bin / time my_program&lt; big_file`,您的程序接收到实际文件的打开文件描述符。您的程序 - 在许多情况下是编写它的语言的I / O库 - 当提供引用常规文件的文件描述符时,可能会采取不同的操作。它可以使用mmap(2)将输入文件映射到其地址空间,而不是使用显式的read(2)系统调用。这些差异对基准测试结果的影响要大于运行`cat`二进制文件的小成本。

    当然,如果同一个程序在两个案例之间的表现有很大不同,那么这是一个有趣的基准测试结果。它表明,实际上,程序或其I / O库正在做一些有趣的事情,比如使用mmap()。所以在实践中,以两种方式运行基准测试可能会很好;也许用一些小因素来折扣“猫”的结果,以及原谅&#34;运行`cat`本身的成本。

答案 3 :(得分:85)

我在Mac上使用g ++在计算机上复制了原始结果。

while循环之前将以下语句添加到C ++版本,使其与Python版本内联:

std::ios_base::sync_with_stdio(false);
char buffer[1048576];
std::cin.rdbuf()->pubsetbuf(buffer, sizeof(buffer));

sync_with_stdio将速度提高到2秒,设置更大的缓冲区将其降低到1秒。

答案 4 :(得分:36)

getline,流操作符scanf,如果您不关心文件加载时间或加载小文本文件,则可以很方便。但是,如果性能是您关心的,那么您应该将整个文件缓冲到内存中(假设它适合)。

以下是一个例子:

//open file in binary mode
std::fstream file( filename, std::ios::in|::std::ios::binary );
if( !file ) return NULL;

//read the size...
file.seekg(0, std::ios::end);
size_t length = (size_t)file.tellg();
file.seekg(0, std::ios::beg);

//read into memory buffer, then close it.
char *filebuf = new char[length+1];
file.read(filebuf, length);
filebuf[length] = '\0'; //make it null-terminated
file.close();

如果需要,可以将流包裹在该缓冲区周围,以便更方便地访问:

std::istrstream header(&filebuf[0], length);

此外,如果您控制文件,请考虑使用平面二进制数据格式而不是文本。读取和写入更可靠,因为您不必处理空白的所有歧义。它解析起来也更小,速度更快。

答案 5 :(得分:16)

顺便说一句,C ++版本的行数大于Python版本的行数的原因是eof标志仅在尝试读取超出eof时才设置。所以正确的循环是:

while (cin) {
    getline(cin, input_line);

    if (!cin.eof())
        line_count++;
};

答案 6 :(得分:15)

以下代码对我来说比目前为止发布的其他代码更快: (Visual Studio 2013,64位,500 MB文件,行长度统一为[0,1000))。

const int buffer_size = 500 * 1024;  // Too large/small buffer is not good.
std::vector<char> buffer(buffer_size);
int size;
while ((size = fread(buffer.data(), sizeof(char), buffer_size, stdin)) > 0) {
    line_count += count_if(buffer.begin(), buffer.begin() + size, [](char ch) { return ch == '\n'; });
}

它使我的所有Python尝试超过2倍。

答案 7 :(得分:13)

在你的第二个例子中(使用scanf()),为什么它仍然较慢可能是因为scanf(“%s”)解析字符串并查找任何空格char(空格,制表符,换行符)。

此外,是的,CPython会进行一些缓存以避免硬盘读取。

答案 8 :(得分:11)

答案的第一个要素:<iostream>很慢。该死的慢。我使用scanf获得了巨大的性能提升,如下所示,但它仍然比Python慢​​两倍。

#include <iostream>
#include <time.h>
#include <cstdio>

using namespace std;

int main() {
    char buffer[10000];
    long line_count = 0;
    time_t start = time(NULL);
    int sec;
    int lps;

    int read = 1;
    while(read > 0) {
        read = scanf("%s", buffer);
        line_count++;
    };
    sec = (int) time(NULL) - start;
    line_count--;
    cerr << "Saw " << line_count << " lines in " << sec << " seconds." ;
    if (sec > 0) {
        lps = line_count / sec;
        cerr << "  Crunch speed: " << lps << endl;
    } 
    else
        cerr << endl;
    return 0;
}

答案 9 :(得分:10)

好吧,我看到你在第二个解决方案中从cin切换到scanf,这是我要给你的第一个建议(cin是sloooooooooooow)。现在,如果您从scanf切换到fgets,您会看到性能的另一个提升:fgets是字符串输入的最快C ++函数。

BTW,不知道那个同步的事情,不错。但你仍然应该尝试fgets