我正在开始一项研究项目，需要确定一种编程语言和3D图形API，我将在分子细胞生物学领域创建一个环境，在那里我将模拟大量的计算机实验。实验将在离散时间内完成，并将包含复杂的物理引擎。漂亮的图形并不重要。
过去几周我一直在研究不同的选项，并且在开始实施之前想要第二个意见。
由于灵活性，可扩展性，库/依赖性组织（我爱上了Maven）以及OOP语言的其他好处，目前我决定使用Java作为语言。这个项目将继续增长，复杂性将继续增加，所以这对我来说是一个很大的因素。我已经研究过使用Python和Matlab，因为许多人在模拟中使用这些语言，但缺乏可维护性和可伸缩性一直让我回到Java。我使用Matlab或Python阅读的大多数项目也很小和/或原型，所以这对他们来说不是问题。我过滤掉了Python和Matlab，因为它们主要是动态语言，不能像C ++或Java一样扩展。我是一个Java人，所以这就是为什么我更倾向于Java而不是C ++。我想更多地关注算法而不是使用C ++时所需的内存管理和库依赖性，但是使用C ++的额外速度是一个优势。
至于3D图形我已经决定使用OpenGL（如果用Java完成将使用JOGL），因为它是如此低级别，我将拥有完全控制，大型文档和社区。我已经研究过JMonkeyEngine，但我觉得它有点臃肿，因为它是一个游戏库。我也有一些通过Python或C ++使用Maya的建议，但我没有看到使用Maya有什么优势。我的模型将充满活力，最初的“世界”几乎是空的，更不用说我不关心外观。还有使用物理引擎的问题，这是Maya最初向我建议的部分原因。由于我的模型所涉及的物理学的复杂性，我害怕使用现有的物理引擎，我不会像我刚刚实现它们一样控制自己。
总的来说，对于我的应用程序来说，带有JOGL的Java听起来像是一条坚实的前进道路？我想，如果需要的话，我可以在不久的将来转换到C ++ / OpenGL，我认为这不是一项太大的任务。这是我将要创建的第一个模拟环境，我是否遗漏或遗漏了任何其他考虑因素？ 任何想法，反馈，意见或任何其他建议将不胜感激。谢谢， 威尔