Question

我在R Studio中手动运行时有一个正常运行的脚本，但是当我通过包装器从另一个程序运行它时它不起作用。

我在调试输出中收到此信息：

[912] Error in xj[i] : only 0's may be mixed with negative subscripts 
[912] Calls: GetTopN -> cor -> is.data.frame -> [ -> [.data.frame

如果我在收到错误之前保存图像然后在R Studio中加载它，那么当我执行GetTopN(10)时会出现同样的错误。但是，如果我在R Studio中重新运行语句actionlist<- sqlQuery(channel,al_string)然后执行GetTopN(10)，一切正常。

我甚至试图在关键调用之前将图像保存在R Studio中，然后在执行GetTopN（10）之前通过包装器加载它并且我得到了相同的错误。

我检查了所有相关变量（crs，z，x，n）似乎具有正确的值。我不知道这可能是什么原因，我真的很感激一些帮助！

以下是正在执行的内容（按顺序）：

#INIT:
library(RODBC)
library(stats)

channel<- odbcConnect("data")
crs<-mat.or.vec(3000,5) #will hold correlations
n1<-seq(-33,0)

#Get whole series
z <- sqlQuery(channel,"SELECT RPos,M1,M2,M3,M4 FROM `data`.`z` ")
al_string <- "SELECT RPos,OpenTime FROM z JOIN actionlist on(OpenTime = pTime)"
trim_string<- "DELETE FROM ActionList WHERE OpenTime NOT IN (SELECT OpenTime FROM ReducedList)"

GetTopN<-function(n)
{ 
  for(i in 1:nrow(actionlist))
  {
   crs[i,1]<-actionlist$OpenTime[i]
   for(j in 2:ncol(z)) 
   {
    crs[i,j]<-cor(z[actionlist$RPos[i]+n1,j],x[,j])
   }
  }
  avc <- (cbind(crs[,1],rowSums(crs[,2:5])))
  sorted <- crs[order(avc[,2], decreasing=T),1] 
  topx<- head(sorted,n)
  bottomx <- tail(sorted,n)
  DF<-as.data.frame(c(topx,bottomx),row.names=NULL) 
  colnames(DF)[1]<-'OpenTime'
  sqlSave(channel,dat=DF,tablename='ReducedList',append=F,rownames=F,safer=F) 
  sqlQuery(channel,trim_string)
}


curpTime <- 1275266400
actionlist<- sqlQuery(channel,al_string)

x<- sqlQuery(channel,paste('SELECT pTime,M1,M2,M3,M4 FROM z WHERE pTime <= ',curpTime,' AND 
pTime > ',curpTime,'-(300*34) ORDER BY pTime ASC'))

GetTopN(10)

如果有帮助的话，我也保存了我的工作区（4.7mb）：workspace 如果连接到我的MYSQL数据库会有所帮助，它应该在74.73.17.163:3306

上打开

Answer 1

问题：actionlist$RPos[1000]的值为21. n1范围从-31到0.当您添加它们时，您会得到一个混合了正值和负值的向量，这不是允许子集化。

我是如何到达那里的：首先检查traceback()：

traceback()
5: `[.data.frame`(z, actionlist$RPos[i] + n1, j) at #8
4: z[actionlist$RPos[i] + n1, j] at #8
3: is.data.frame(x) at #8
2: cor(z[actionlist$RPos[i] + n1, j], x[, j]) at #8
1: GetTopN(10)

这告诉我问题最有可能在actionlist$RPos[i] + n1。然后我只添加了一个简单的print(i)语句来告诉我哪个迭代是问题。（或者，您可能刚刚手动检查了actionlist$RPos + n1的问题点。

Answer 2

对于tidyverse用户，如果尝试对已分组的df进行子集设置，dplyr会出现此错误，您需要先调用ungroup。

R调试：“只有0可以与负下标混合”

2 个答案: