这可能会成为一个相当微不足道的问题，但让我感到困惑已有一段时间了。这一切都是在我安装通用文档转换器pandoc并将其添加到我的路径时开始的。因此，当我在Mac OS X上的默认终端上echo $PATH时，它会显示pandoc并且我能够执行它。
但是，当我尝试使用system(pandoc --version)在R会话中调用相同内容时，它无法识别pandoc。进一步检查发现system('echo $PATH')没有返回我在终端上获得的路径。
任何人都可以帮我解决发生的事情吗？我喜欢在RStudio上完成所有工作，因此我希望能直接从内部使用pandoc。因此需要弄清楚这一点。
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R和bash（毫无疑问是Rstudio）每个都创建了独立的环境。 Terminal.app使用自己的默认PATH设置启动bash会话。当Simon Urbanek最近回答这个问题时，他将提问者提到了R-Mac-FAQ 12.19。他的完整回应是在R-SIG-MAC档案中。在我的邮件客户端上，它显示主题行Re：[R-SIG-Mac] PATH，日期为2012年1月30日。他还将提问者提到：http://developer.apple.com/library/mac/#qa/qa1067/_index.html
正如?EnvVar告诉您：＆＃34; Sys.getenv和Sys.setenv在R会话中读取和设置环境变量。＆＃34;但是你似乎已经意识到了这些功能。