Question

我正在尝试在R中编写一个函数，以类似的方式批量分析大量文件。这些文件属于ExpressionSetIllumina类。我可以创建一个字符（字符串）向量，其中包含目录中所有文件的名称，并加载每个文件：

list = list.files()
for (i in list[1]) {    
  load(i)
}

这会正确加载文件

> ls()
[1] "i"                    "list"                 "SSD.BA.vsn"
> class(SSD.BA.vsn)
[1] "ExpressionSetIllumina"
attr(,"package")
[1] "beadarray"

我现在要做的是使用i（字符串"SSD.BA.vsn"）将对象SSD.BA.vsn分配给新的对象数据，以便：

>data = SomeFunction(i)
>class(data)
[1] "ExpressionSetIllumina"
attr(,"package")
[1] "beadarray"

但是到目前为止我所尝试的只是将数据作为与i相同值的字符向量返回，或者根本不起作用。所以我想知道是否有一个功能可以为我做，或者我是否需要以其他方式去做。

我将一个对象或变量的名称存储为字符向量中的字符串。如何使用字符串对象名称对对象执行某些操作？

Answer 1

我想你想要get。

data <- get(i)

也就是说，一旦你开始使用get（及其对应的assign），你通常会得到可怕的无法读取的代码。

对于像您这样的批量分析，通常最好将所有数据读入数据框列表，然后自由使用lapply。类似的东西：

data_files <- list.files()
all_vars <- lapply(data_files, function(file)
{
  vars_loaded <- load(file)
  mget(vars_loaded, parent.frame())
})

mget是get的版本，可以一次检索多个变量。在这里，它用于检索由加载调用加载的所有内容。

现在你有了一个列表列表：顶级列表与文件相关，低级列表包含从该文件加载的变量。

如何使用相同名称的字符变量调用对象

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