Question

我试图通过替换以“：”分隔的2列的值来修改制表符分隔文件，其中一列中有空值：

从这个文件开始：

id1 id2 pos1    pos2
749 2847443 21  13517135
862 2821796 21  13571669
997     21  13636494
1095    2821826 21  13661335
1131        21  13678797

我想修改第2列以获取此信息：

id1 id2 pos1    pos2
749 2847443 21  13517135
862 2821796 21  13571669
997 21:13636494 21  13636494
1095    2821826 21  13661335
1131    21:13678797 21  13678797

问题还在于没有空格（“”）表示空值。现在，当它为空时，我甚至无法用第3列替换第2列的值......

我尝试过使用sed：

sed -e 's/\t\t/\t$3\t/g' input.txt > output

哪个有效，但它只是替换文本'$ 3'而我找不到如何替换$ 3：$ 4的值。

我也试过awk：

awk 'BEGIN {
  IFS = OFS = "\t"
 }
{
    for (column = 2; column <= NF; ++column) {
    if ($column == "") {
        $column = $3
    }
 }    
 print 
}         
'
input.txt > output

但这也不起作用（它实际上没有使用“”也没有“”......）

你能帮帮我吗？谢谢。

Answer 1

检查空值实际上很容易。但我不太了解这个要求。哪列可以为空？在你的awk脚本中，你有来自$ 2-＆gt; $ NF的循环，如果有空列，你没有设置为“：”分隔值，但设置为$ 3。 3美元的价值是多少？

我假设只有$ 2（column2）可以为null，那么下面的awk行应该可以完成这项工作。

 awk -F'\t' -vOFS='\t' '!$2{$2=$3":"$4}1' file

<强>测试

<ff is your input file>

kent$  awk -F'\t' -vOFS='\t' '!$2{$2=$3":"$4}1' ff          
id1     id2     pos1    pos2
749     2847443 21      13517135
862     2821796 21      13571669
997     21:13636494     21      13636494
1095    2821826 21      13661335
1131    21:13678797     21      13678797

要清楚地看到它，我们可以将输出传递给列命令：

kent$  awk -F'\t' -vOFS='\t' '!$2{$2=$3":"$4}1' ff|column -t
id1   id2          pos1  pos2
749   2847443      21    13517135
862   2821796      21    13571669
997   21:13636494  21    13636494
1095  2821826      21    13661335
1131  21:13678797  21    13678797

希望它对你有所帮助。

Answer 2

查看您发布的文本之前/之后

B:    997       21  13636494
A:    997   21:13636494 21  13636494

如果为空，则要替换第二列使用3rd + '**:**' + 4th column，对吧？

所以去吧：

sed 's/\(.*\)\t\t\(.*\)\t\(.*\)/\1\t\2:\3\t\2\t\3/g' testfile

匹配

的行

某些标签选项卡

并将其替换为

第1栏标签第3栏：第4栏标签第3栏标签第4栏

示例：

$ cat testfile
749 2847443 21  13517135
862 2821796 21  13571669
997     21  13636494
1095    2821826 21  13661335
1131        21  13678797

$ sed 's/\(.*\)\t\t\(.*\)\t\(.*\)/\1\t\2:\3\t\2\t\3/g' testfile
749 2847443 21  13517135
862 2821796 21  13571669
997 21:13636494 21  13636494
1095    2821826 21  13661335
1131    21:13678797 21  13678797

注意：这只会查找缺少的第二列，正如您所谈到的那样

PS：如果您认为这可以回答您的问题，请不要忘记将其标记为正确答案

如果使用awk / sed将一列的值为null，则替换其他列中的值

2 个答案: