组合列表中包含的以下向量时遇到问题:
x <- list(as.numeric(c(1,4)),as.numeric(c(3,19,11)))
names (x[[1]]) <- c("species.A","species.C")
names (x[[2]]) <- c("species.A","species.B","species.C")
给出以下列表:
>x >[[1]] >species.A species.C > 1 4 >[[2]] >species.A species.B species.C > 3 19 11
使用do.call函数组合它们:
y<- do.call(cbind,x)
给出:
>y > [,1] [,2] > species.A 1 3 > species.B 4 19 > species.C 1 11
虽然我想获得这个:
> [,1] [,2] > species.A 1 3 > species.B NA 19 > species.C 4 11
答案 0 :(得分:5)
你需要给R一点帮助,首先准备你最终想要cbind
一起的特定向量,所有长度都相同。否则(正如您所见)R使用其通常的回收规则来填写矩阵。
尝试这样的事情:
spp <- paste("species", c("A", "B", "C"), sep=".")
x2 <- lapply(x, FUN=function(X) X[spp])
mat <- do.call("cbind", x2)
row.names(mat) <- spp
mat
[,1] [,2]
species.A 1 3
species.B NA 19
species.C 4 11
编辑:正如Brian在评论中提到的那样,这可以更加紧凑(但是以牺牲一些可读性为代价)。你使用哪一个只是一个品味问题:
mat <- do.call("cbind", lapply(x, "[", spp))
row.names(mat) <- spp
答案 1 :(得分:5)
看起来你真的想要合并。因此,merge
将起作用。你只需告诉它合并名称,并保留所有行。
do.call(merge, c(x, by=0, all=TRUE)) # by=0 and by="row.names" are the same
(这将创建一个数据框而不是矩阵,但对于大多数目的而言,这不应该是一个问题。)
答案 2 :(得分:1)
merge(x = x[[1]], y = x[[2]], by = "names", all.y = TRUE)