Question

我必须绘制一些绘图（x，y）散射图，但我希望这些点基于连续变量z的值进行颜色编码。

我想要一个温度调色板（从深蓝色到亮红色）。我尝试使用Rcolorbrewer但是RdBu调色板（类似于温度调色板）使用白色作为中间值，看起来非常糟糕。

我还想绘制一个图例，用颜色样本和相应的值来解释颜色编码。

如果可以在R中轻松执行此任何想法？请不要ggplot！

向所有人致以节日的问候

Answer 1

这里有一些自制代码用默认包（base，graphics，grDevices）来实现它：

# Some data
x <- 1:1000
y <- rnorm(1000)
z <- 1:1000

# colorRamp produces custom palettes, but needs values between 0 and 1
colorFunction <- colorRamp(c("darkblue", "black", "red"))
zScaled <- (z - min(z)) / (max(z) - min(z))

# Apply colorRamp and switch to hexadecimal representation
zMatrix <- colorFunction(zScaled)
zColors <- rgb(zMatrix, maxColorValue=255)

# Let's plot
plot(x=x, y=y, col=zColors, pch="+")

对于StanLe，这里是相应的图例（由layout或类似的东西添加）：

# Resolution of the legend
n <- 10

# colorRampPalette produces colors in the same way than colorRamp
plot(x=NA, y=NA, xlim=c(0,n), ylim=0:1, xaxt="n", yaxt="n", xlab="z", ylab="")
pal <- colorRampPalette(c("darkblue", "black", "red"))(n)
rect(xleft=0:(n-1), xright=1:n, ybottom=0, ytop=1, col=pal)

# Custom axis ticks (consider pretty() for an automated generation)
lab <- c(1, 500, 1000)
at <- (lab - min(z)) / (max(z) - min(z)) * n
axis(side=1, at=at, labels=lab)

Answer 2

根据@BenBolker的回答，如果你看一下filled.contour的代码，你可以做传奇。我把这个功能分开来看起来像这样：

    scatter.fill <- function (x, y, z, 
                              nlevels = 20, plot.title, plot.axes, 
                              key.title, key.axes, asp = NA, xaxs = "i", 
                              yaxs = "i", las = 1, 
                              axes = TRUE, frame.plot = axes, ...) 
    {
        mar.orig <- (par.orig <- par(c("mar", "las", "mfrow")))$mar
        on.exit(par(par.orig))
        w <- (3 + mar.orig[2L]) * par("csi") * 2.54
        layout(matrix(c(2, 1), ncol = 2L), widths = c(1, lcm(w)))
        par(las = las)
        mar <- mar.orig
        mar[4L] <- mar[2L]
        mar[2L] <- 1
        par(mar = mar)

        #Some simplified level/color picking
        levels <- seq(min(z),max(z),length.out = nlevels)
  col <- colorRampPalette(c("blue","red"))(nlevels)[rank(z)]

        plot.new()
        plot.window(xlim = c(0, 1), ylim = range(levels), xaxs = "i", 
            yaxs = "i")
  rect(0, levels[-length(levels)], 1, levels[-1L], col = colorRampPalette(c("blue","red"))(nlevels)
        if (missing(key.axes)) {
            if (axes) 
                axis(4)
        }
        else key.axes
        box()
        if (!missing(key.title)) 
            key.title
        mar <- mar.orig
        mar[4L] <- 1
        par(mar = mar)

        #Simplified scatter plot construction
        plot(x,y,type = "n")
        points(x,y,col = col,...)

        if (missing(plot.axes)) {
            if (axes) {
                title(main = "", xlab = "", ylab = "")
                Axis(x, side = 1)
                Axis(y, side = 2)
            }
        }
        else plot.axes
        if (frame.plot) 
            box()
        if (missing(plot.title)) 
            title(...)
        else plot.title
        invisible()
    }

然后应用Ben的例子中的代码，我们得到了这个：

x <- runif(40)
y <- runif(40)
z <- runif(40)
scatter.fill(x,y,z,nlevels = 40,pch = 20)

产生这样的情节：

enter image description here

公平警告，我确实只是破解了filled.contour的代码。您可能希望检查剩余的代码并删除未使用的位，或者修复我无效的部分。

Answer 3

这是一个合理的解决方案 - 我使用蓝色而不是深蓝色作为起点，但您可以查看?rgb等来根据自己的喜好调整颜色。

nbrk <- 30
x <- runif(20)
y <- runif(20)
cc <- colorRampPalette(c("blue","red"))(nbrk)
z <- runif(20)
plot(x,y,col=cc[cut(z,nbrk)],pch=16)

颜色代码基于另一个值的散点图 - 没有ggplot

3 个答案: