Can Sweave会自动生成许多pdf吗？

Question

我分析来自许多城市的测量数据（数百个），并且需要为每个城市创建单独的报告（采用Adobe pdf格式）。

我的流程是这样的：

1. 首先准备要显示的数据的RStudio，保存在X.Rda。
2. 在X.Rnw（RStudio）中，我阅读了X.Rda，选择了一个城市，并制作了表格和图表。
3. 在RStudio中，按“编译PDF”，生成城市报告X.pdf。
4. 我转到第2步，选择其他城市，依此类推。

这非常繁琐，看起来非常适合每个城市的循环，但它怎么能完成？

谢谢r-contributors！

/克里斯

Answer 1

您可以使用类似for循环的全局变量更改，它可以控制您要编入报表的城市;请参阅其他帖子Run Sweave or knitr with objects from existing R session

代码就像（假设cities是一个字符向量，我使用knitr包作为示例，因为您可以指定输出的文件名）：

for (city in cities) {
   knit('city_template.Rnw', output = paste('report_', city, '.tex', sep = ''))
}

在city_template.Rnw内，你有一个像

这样的大块

<<do-my-job>>=
make_plot(city, ...)
whatever(city, ...)
@

然后你将获得一系列由城市命名的tex文件，你的工作的其余部分是将它们编译成PDF（RStudio不可能编译多个tex文件，AFAIK，但是它很简单。命令行或在带有texi2dvi()）的R中。

您需要注意一件事 - 您必须为每个输出文件使用不同的数字前缀（选项fig.path），否则不同的城市可以覆盖彼此的数字输出。在knitr中，可以通过以下方式完成：

<<setup, echo=FALSE>>=
opts_chunk$set(fig.path = paste('my-prefix-', city, sep = ''))
@

我认为通过循环生成许多报告应该是安全的。

顺便说一句，你可以用Sweave达到同样的目标;也许你会知道为什么我后来开发knitr（这是偏离主题的，所以我不会在这里扩展）。

Answer 2

• 在R environnent中这样做。
• 将特定城市的所有输出放入列表
• 用块来编写你的RnW只需调用输出
• 将您的R图像保存在与Sweave报告相同的文件夹中，并将wd设置为同一文件夹
• Sweave（＆＃34; yourfile.RnW＆＃34;，output =＆＃34; yourcity.tex＆＃34;）
• 使用texi2dvi从R
编译tex文件

如果你有很多城市，你应该把它放到一个功能中。