Question

目标： 从wordpress页面运行一个简单的Rscript。

我正在尝试在加载页面时使用exec（）运行Rscript。该脚本从整数1到10创建100个随机样本的直方图，将系统时间写入标题并将数字保存到.png文件。

设置：

在Ubuntu EC2微型实例上运行Wordpress安装
已成功安装并通过ssh
使用Exec-PHP Wordpress插件，以便可以编写和执行（成功测试）PHP代码

PHP代码（在wordpress页面内）

    <?php 
    echo "This is the Exec-PHP 'Hello World'\n"; 
    echo exec("date");
    ?>

    <?php
    exec("Rscript <PATH>/test.R");
    ?>

    <img src="<Image Location>/samplePlot.png" alt="" title="Sample R" />

Rscript - test.R

    png( "<Image Location>/samplePlot.png")
    hist( sample( 1:10, 100, replace = TRUE), main= Sys.time(), lwd = 5)
    dev.off()

图像文件加载但未更新，表明Rscript从未执行过。我把它分解为问题，但不确定为什么会这样。

我该如何调试？我真的不知道任何PHP，但我尝试了以下内容：

    <?php
    exec("\usr\bin\Rscript <PATH>/test.R", $output, $result);
    echo $output;
    echo $result
    ?>

返回：

Array2

我希望得到命令行输出以检查错误。这可能吗？

Answer 1

我认为问题在于你没有指定Rscript的完整路径，而运行PHP / Apache的用户只是不知道在哪里搜索它。

更新exec命令（在Linux上）：

exec("/usr/bin/Rscript <PATH>/test.R");

无论如何，我建议稍后为该任务安装littler并（基于此）运行r而不是Rscript，以便让事情运行得更快 - 如果安装，例如。 rApache不是一种选择。

Answer 2

要了解问题，请尝试：

$e = exec("\usr\bin\Rscript <PATH>/test.R 2>&1");
var_dump($e);

如果你得到类似的东西：dyn.load中的错误（文件，DLLpath = DLLpath，......）...... 您可能需要更新服务器动态库（尝试搜索libfreetype.dylib），或者如果您正在运行MAMP（我是），您需要注释（＃）两个未注释的行：/ Applications / MAMP / Library / bin / envvars中

我知道你发布这个问题需要很长时间，但是我花了很多时间处理类似的问题 - 希望有人可以节省一些时间;）

从wordpress install运行exec（）Rscript

2 个答案: