我试图获得数据框中所有行相对于彼此的Pearson相关系数。有些值是空的(NA),这似乎是一个问题,我在两个缺少值的向量上运行cor()时没有遇到这个问题。这是2个向量的正确结果:
x <- c(NA, 4.5, NA, 4, NA, 1)
y <- c(2.5, 3.5, 3, 3.5, 3, 2.5)
cor(x,y, use = "complete.obs")
[1] 0.9912407
以下是数据框中的结果:
cor(t(critics1), use = "complete.obs")
y a b c d e x
y 1 NA NA NA NA NA NA
a NA 1 1 1 -1 1 -1
b NA 1 1 1 -1 1 -1
c NA 1 1 1 -1 1 -1
d NA -1 -1 -1 1 -1 1
e NA 1 1 1 -1 1 -1
x NA -1 -1 -1 1 -1 1
Warning message:
In cor(t(critics1), use = "complete.obs") : the standard deviation is zero
为什么use参数不具有相同的效果? 以下是批评者1数据框的样子;
film1 film2 film3 film4 film5 film6
y 2.5 3.5 3.0 3.5 3.0 2.5
a 3.0 3.5 1.5 5.0 3.0 3.5
b 2.5 3.0 NA 3.5 4.0 NA
c NA 3.5 3.0 4.0 4.5 2.5
d 3.0 4.0 2.0 3.0 3.0 2.0
e 3.0 4.0 NA 5.0 3.0 3.5
x NA 4.5 NA 4.0 NA 1.0
答案 0 :(得分:7)
正如@joran推测的那样,当你转置critics1
时,只有两个完整的观察结果(即没有缺失值的行)。这就是为什么所有关联都是1
或-1
或(对于那些涉及y
的关联,在两个完整行中都为3.5){。1}}。
NA
如果您使用t(critics1)
# y a b c d e x
# film1 2.5 3.0 2.5 NA 3 3.0 NA
# film2 3.5 3.5 3.0 3.5 4 4.0 4.5
# film3 3.0 1.5 NA 3.0 2 NA NA
# film4 3.5 5.0 3.5 4.0 3 5.0 4.0
# film5 3.0 3.0 4.0 4.5 3 3.0 NA
# film6 2.5 3.5 NA 2.5 2 3.5 1.0
代替use="pairwise.complete.obs"
,则可以按照您的意愿使用:
use="complete.obs"