Question

使用sweave / pgfsweave进行编译时，每次在R中创建一个图形时，它都会在图形窗口中显示（在sweave编译过程中）。这在许多情况下很有用，因为我可以看到在编译文档时数字的样子。

但是当我通过ssh编译一个大文档时，这可能会很慢。有没有办法告诉sweave / pgfsweave以避免在编译期间显示图形（我仍然想要最终的pdf文档中的图形）。

Answer 1

对于交互式会话，figs.only Sweave选项可控制此行为。要仅将图形绘制到目标图形文件（并且不到控制台图形窗口），请设置figs.only=TRUE。

如RweaveLatex帮助文件中所述：

figs.only：逻辑（'FALSE'）。默认情况下，每个图块都会运行一次，然后重新运行每种选定类型的图形。那将打开第一个数字的默认图形设备 chunk并使用该设备进行首次评估后续的块。如果此选项为true，则为数字块仅针对每种选定类型的图形运行，其中a 新图形设备打开然后关闭。

与其他Sweave选项一样，您可以设置此选项：（1）用于当前编译（例如Sweave("example.Rnw", figs.only=TRUE);（2）在.Rnw文件中，使用\SweaveOpts{figs.only=TRUE};或者（3）作为全局默认值，将SWEAVE_OPTIONS="figs.only=TRUE"放入，例如$R_HOME/etc/Renviron.site

Answer 2

figs.only是正确的方法，我也想提一下R中的默认图形设备：

现在您可以看一下：http://yihui.name/en/2010/12/a-special-graphics-device-in-r-the-null-device/

在R 2.14.1（尚未发布）之后，您将能够将默认设备设置为空PDF设备，既安全又快速：https://github.com/yihui/knitr/issues/9

Answer 3

如果您从命令行而不是在交互式会话中进行扫描，则不会在交互式图形窗口中生成图形。

只需键入R CMD Sweave mydoc.Rnw或通过批处理文件或大型项目的makefile，即可从命令行运行R.我已经开始在我的许多sweave文档中使用makefile，因为它处理依赖关系，可以清理自己以及更多。

Answer 4

一个选项可能是

<<label=myplotlabel, fig=TRUE, include=FALSE>>=
graph code
@

然后

\begin{figure}[h]
   \includegraphics[width=6cm, height=6cm]{myplotlabel}
   \caption{My Plot}
   \label{fig:label}
\end{figure}

避免在sweave / pgfsweave编译期间显示的数字

4 个答案: