如何使用Python将嵌入式Neo4j图形数据库转换为GraphML？

Question

我想将我的嵌入式Neo4j Graph数据库存储到GraphML中，以便用yEd这样的工具绘制它。

我正在用python27管理图表数据库。

有没有人知道这样做的方法？

Answer 1

如果您能够在流程之外完成此操作 - 这意味着您需要关闭在嵌入式数据库上工作的现有流程，并在完成导出后重新启动 - 您可以使用Gremlin去做吧。这是您需要的命令：

g = new Neo4jGraph("/YOUR/GRAPH/DIRECTORY")
writer = new GraphMLWriter(g)
out = new FileOutputStream("/YOUR/GRAPHML/file.graphml")
writer.outputGraph(out)
writer.setNormalize(true)
out.close()

这将创建一个漂亮的漂亮graphml文件，适合阅读Gephi或Cytoscape等工具。

如果你需要在进程中导出图形，你需要使用像jython这样的东西来运行你的python脚本，然后通过从com.tinkerpop.blueprints导入对象来使用上面的命令。

Answer 2

如果neo4j.py不支持导出为GraphML格式，或者由于任何原因你无法使用Neo4j + Java，那么你必须编写一个自定义导出器。

使用NetworkX可以实现一些简单的黑客攻击，它支持从/导出到GraphML。想办法将你的Neo4j图导入NetworkX，然后直接导出到GraphML。