MPI4Py Scatter sendbuf Argument Type?

时间:2009-05-03 23:47:51

标签: python parallel-processing mpi

我在使用MPI4Py Python模块中的Scatter函数时遇到问题。 我的假设是我应该能够为sendbuffer传递一个列表。但是,当我这样做时,我收到一致的错误消息,或者确实添加了另外两个参数,recvbuf和root:

  File "code/step3.py", line 682, in subbox_grid
    i = mpi_communicator.Scatter(station_range, station_data)
  File "Comm.pyx", line 427, in mpi4py.MPI.Comm.Scatter (src/
mpi4py_MPI.c:44993)
  File "message.pxi", line 321, in mpi4py.MPI._p_msg_cco.for_scatter
(src/mpi4py_MPI.c:14497)
  File "message.pxi", line 232, in mpi4py.MPI._p_msg_cco.for_cco_send
(src/mpi4py_MPI.c:13630)
  File "message.pxi", line 36, in mpi4py.MPI.message_simple (src/
mpi4py_MPI.c:11904)
ValueError: message: expecting 2 or 3 items

以下是剪切的相关代码,从682以上开始几行 如上所述。

for station in stations
        #snip--do some stuff with station
        station_data = []
        station_range = range(1,len(station))
        mpi_communicator = MPI.COMM_WORLD
        i = mpi_communicator.Scatter(station_range, nsm)
        #snip--do some stuff with station[i]
        nsm = combine(avg, wt, dnew, nf1, nl1, wti[i], wtm, station[i].id)
        station_data = mpi_communicator.Gather(station_range, nsm)

我尝试了一些初始化station_range的组合,但是我 不能正确理解Scatter参数类型。

Python / MPI大师是否对此进行了澄清?

1 个答案:

答案 0 :(得分:6)

如果要移动原始缓冲区(与Gather一样),则提供三元组[buffer, size, type]。查看演示中的示例。如果要发送Python对象,则应使用更高级别的接口并调用内部使用gather的{​​{1}}(注意小写)。