我可以在ggplot2中获得boxplot凹槽吗？

Question

是的，我知道它已经存在，我也发现Hadley在谷歌团体的答案中表示ggplot2箱形图还没有缺口。所以我的问题是双重的：这已经改变了（已经有一个本地的凹口实现），如果没有，那么可以做些什么。

我的意思是我不需要缺口光学元件，代表一些阴影区域的置信区间，它适合放置在盒子图上的另一层中，看起来也不错。

还添加了屏幕截图，因为我听说图形问题在没有图形的情况下永远不会完整

Answer 1

<强>更新 除了下面详述的选项外， ggplot2 的0.9.0版还在geom_boxplot中包含此功能。检查?geom_boxplot会显示notch和notchwidth参数：

+ geom_boxplot(notch = TRUE, notchwidth = 0.5)

---

不是优雅的图形，但这是一个例子：

# confidence interval calculated by `boxplot.stats`
f <- function(x) {
    ans <- boxplot.stats(x)
    data.frame(ymin = ans$conf[1], ymax = ans$conf[2])
}

# overlay plot (upper panel below)
p <- ggplot(iris, aes(Species, Sepal.Length)) + geom_boxplot() +
  stat_summary(fun.data = f, geom = "linerange", colour = "skyblue", size = 5)
p

# base graphics (lower panel below)
boxplot(Sepal.Length ~ Species, data = iris, notch = TRUE)

你可以通过调整stat_summary的参数来改变CI栏的表现。

crossbar版本：

f <- function(x) {
  ans <- boxplot.stats(x)
  data.frame(ymin = ans$conf[1], ymax = ans$conf[2], y = ans$stats[3])
}

p <- ggplot(iris, aes(Species, Sepal.Length)) + 
  geom_boxplot(width = 0.8) +
  stat_summary(fun.data = f, geom = "crossbar", 
    colour = NA, fill = "skyblue", width = 0.8, alpha = 0.5)
p

Answer 2

可能有趣的是，在ggplot2-dev mailing list上发布了一篇关于notched box plots的帖子。

您可以在github找到开发页面。该软件包可以通过以下方式安装：

# install.packages("devtools")
library(devtools)
install_github("ggplot2")