Question

我正在尝试使用ggplot绘制包含大约2900万个值的大型数据集的CDF曲线。我计算它的方式是这样的：

mycounts = ddply(idata.frame(newdata), .(Type), transform, ecd = ecdf(Value)(Value))
plot = ggplot(mycounts, aes(x=Value, y=ecd))

这需要很长时间才能完成。我想知道是否有一种干净的方法只绘制该数据集的样本（例如，每10点或50点）而不影响实际结果？

Answer 1

我不确定您的数据结构，但简单的sample调用可能就足够了：

n <- nrow(mycounts)                              # number of cases in data frame
mycounts <- mycounts[sample(n, round(n/10)), ]   # get an n/10 sample to the same data frame

Answer 2

在绘制图像之前，您可以将数据集量化为足够的分辨率，而不是采用每个 n 点吗？这样，你就不必绘制你不需要（或看不到）的分辨率。

这是你可以做到的一种方式。（我在下面写的函数是通用的，但该示例使用了您问题中的名称。）

library(ggplot2)
library(plyr)

## A data set containing two ramps up to 100, one by 1, one by 10

tens <- data.frame(Type = factor(c(rep(10, 10), rep(1, 100))),
                   Value = c(1:10 * 10, 1:100))


## Given a data frame and ddply-style arguments, partition the frame
## using ddply and summarize the values in each partition with a
## quantized ecdf.  The resulting data frame for each partition has
## two columns: value and value_ecdf.

dd_ecdf <- function(df, ..., .quantizer = identity, .value = value) {
  value_colname <- deparse(substitute(.value))
  ddply(df, ..., .fun = function(rdf) {
    xs <- rdf[[value_colname]]
    qxs <- sort(unique(.quantizer(xs)))
    data.frame(value = qxs, value_ecdf = ecdf(xs)(qxs))
  })
}


## Plot each type's ECDF (w/o quantization)

tens_cdf <- dd_ecdf(tens, .(Type), .value = Value)
qplot(value, value_ecdf, color = Type, geom = "step", data = tens_cdf)



## Plot each type's ECDF (quantizing to nearest 25)

rounder <- function(...) function(x) round_any(x, ...)
tens_cdfq <- dd_ecdf(tens, .(Type), .value = Value, .quantizer = rounder(25))
qplot(value, value_ecdf, color = Type, geom = "step", data = tens_cdfq)

虽然原始数据集和ecdf集有110行，但量化的ecdf集大大减少了：

> dim(tens)
[1] 110   2
> dim(tens_cdf)
[1] 110   3
> dim(tens_cdfq)
[1] 10  3
> tens_cdfq
   Type value value_ecdf
1     1     0       0.00
2     1    25       0.25
3     1    50       0.50
4     1    75       0.75
5     1   100       1.00
6    10     0       0.00
7    10    25       0.20
8    10    50       0.50
9    10    75       0.70
10   10   100       1.00

我希望这有帮助！： - ）

只绘制一个点的子集？

2 个答案: