Simple wrapping of C code with cython中的示例很好地描述了如何在从numpy传递的数组上计算用C编写的函数,并将结果返回到numpy数组中。
如何做同样的事情却返回2D阵列?即我想评估由两个numpy数组定义的网格上的C函数,并将结果作为numpy 2D数组返回。
这将是这样的(使用与上面的链接相同的功能)。显然现在不能使用双z [],但我不确定如何将2D numpy数组传递给C.
/* fc.cpp */
int fc( int N, const double a[], const double b[], double z[] )
{
for( int i = 0; i < N; i ++ ){
for( int j = 0; j < N; j ++ ){
z[i][j] = somefunction(a[i],b[j]);
}
return N;
}
这是原始的.pyx文件(见下文)。
import numpy as np
cimport numpy as np
cdef extern from "fc.h":
int fc( int N, double* a, double* b, double* z ) # z = a + b
def fpy( N,
np.ndarray[np.double_t,ndim=1] A,
np.ndarray[np.double_t,ndim=1] B,
np.ndarray[np.double_t,ndim=1] Z ):
""" wrap np arrays to fc( a.data ... ) """
assert N <= len(A) == len(B) == len(Z)
fcret = fc( N, <double*> A.data, <double*> B.data, <double*> Z.data )
return fcret
非常感谢。
答案 0 :(得分:1)
您可以将正常数组用于2D矩阵。您只需要为函数指定维度的长度。
在C文件中执行以下操作: (z现在是一个长度为N * N的数组)
int fc( int N, const double a[], const double b[], double z[] )
{
for( int i = 0; i < N; i++ ){
for( int j = 0; j < N; j ++ ){
z[(i*N)+j] = somefunction(a[i],b[j]);
}
return N;
}
在Python中你需要做同样的事情,所以你可以使用带有N * N个元素的一维数组而不是二维矩阵。
更新3D案例
(z现在是长度为N * N * N的数组)
int fc( int N, const double a[], const double b[],const double c[], double z[] )
{
for( int i = 0; i < N; i++ ){
for( int j = 0; j < N; j ++ ){
for( int k = 0; k < N; k ++ ){
z[((i*N)+j)*N+k] = somefunction(a[i],b[j],c[k]);
}
return N;
}