哪里可以找到可靠的K-medoid（非k-means）开源软件/工具？

Question

我正在学习K-medoids算法，所以如果我提出不恰当的问题，我很抱歉。据我所知，K-medoids算法实现了K-means聚类，但使用实际数据点作为质心而不是数学计算方法。

当我在网上搜索时，我发现了许多k-means工具，例如GenePattern，geWengh等等，但不是k-medoids工具。一些好朋友告诉我，在Matlab，还有一个由一些用户编写。但是，我担心个人实现的工具可能仍然存在一些缺陷或限制。因此，我想知道是否有一些广泛使用的可靠的开源软件/工具使用实际数据点作为集群的质心。我需要找出有关实际质心的信息，因此只返回聚类结果是不够的。我更喜欢在线网站，但如果不是这样，我可以将它安装到我的本地机器上。非常感谢，

Answer 1

1. C Clustering Library（source，Manual）中提供了C中的k-medoid implmentation。 （请注意，Cluster 3.0是此库的扩展，可能不提供k-medoids）

   从手册：

     

       

   在C群集库中，有三种分区算法可用：     •k-means聚类     •k-medians聚类     • k-medoids 聚类

     

2. k-medoids in mlpy, Machine Learning library in Python

3. k-medoids in Matlab

4. k-medoids in Java

5. k-medoids in C++

Answer 2

<强>软件：

• ELKI包括几种k-means变体，包括K-medoids和PAM。
• GNU R包含k-means和“cluster”包中的“flexclust”包变体。
• Gap一个关于基于距离的聚类的embrional开源库。

来源：http://en.wikipedia.org/wiki/K-medoids

Answer 3

对于Python，我找到了一个实现PAM和Clara的包：PyCluster