如何使用C#将普通的jpeg图像字节转换为DICOM本机图像字节

时间:2011-09-30 06:34:11

标签: c# jpeg dicom image-conversion

目前我正在编写一个模块,用于将JPEG转换为DICOM Image转换。在分析时,我已完成标记渲染,现在图像未在DICOM文件中正确呈现。

是否有任何算法可以将JPEG转换为DICOM

4 个答案:

答案 0 :(得分:2)

继续Matthieu的回答,这是一个使用优秀的GDCM库和他引用的例子为JPEG流创建DICOM包络的一种非常简单的方法(注意我使用了一些辅助类,但很简单):

       ImageReader r = new ImageReader();
        gdcm.Image image = r.GetImage();
        image.SetNumberOfDimensions(2);
        DataElement pixeldata = DataElementHelper.PixelData;
        string file1 = @"D:\testfil.jpeg";

        System.IO.FileStream infile =
            new System.IO.FileStream(file1, System.IO.FileMode.Open, System.IO.FileAccess.Read);
        //uint fsize = gdcm.PosixEmulation.FileSize(file1);

        //byte[] jstream = new byte[fsize];
        //infile.Read(jstream, 0, jstream.Length);

        byte[] jstream = System.IO.File.ReadAllBytes(file1);
        uint fsize = (uint) jstream.Length;

        SmartPtrFrag sq = SequenceOfFragments.New();
        Fragment frag = new Fragment();
        frag.SetByteValue(jstream, new gdcm.VL((uint)jstream.Length));
        sq.AddFragment(frag);
        pixeldata.SetValue(sq.__ref__());

        // insert:
        image.SetDataElement(pixeldata);


        PhotometricInterpretation pi = new PhotometricInterpretation(PhotometricInterpretation.PIType.MONOCHROME2);
        image.SetPhotometricInterpretation(pi);

        // FIXME hardcoded:
        PixelFormat pixeltype = new PixelFormat(PixelFormat.ScalarType.UINT8);
        image.SetPixelFormat(pixeltype);

        TransferSyntax ts = new TransferSyntax(TransferSyntax.TSType.JPEGBaselineProcess1);
        image.SetTransferSyntax(ts);

        image.SetDimension(0, (uint)1700);
        image.SetDimension(1, (uint)2200);

        ImageWriter writer = new ImageWriter();
        gdcm.File file = writer.GetFile();


        var ds = file.GetDataSet();
        DataElement patientID = DataElementHelper.PatientID;
        DataElement patientName = DataElementHelper.PatientName;
        DataElement accessionNumber = DataElementHelper.AccessionNumber;
        DataElement studyDate = DataElementHelper.StudyDate;
        DataElement studyTime = DataElementHelper.StudyTime;
        DataElement studyInstanceUID = DataElementHelper.StudyInstanceUID;
        DataElement seriesInstanceUID = DataElementHelper.SeriesInstanceUID;
        DataElement mediaStorage = DataElementHelper.SOPClassUID;

        string studyUID = new gdcm.UIDGenerator().Generate();
        string seriesUID = new gdcm.UIDGenerator().Generate();

        //pixelData.SetArray(b, (uint)b.Length);
        DataElementHelper.SetDataElement(ref patientName, "TEST^MARCUS");
        DataElementHelper.SetDataElement(ref patientID, "0000000801");
        DataElementHelper.SetDataElement(ref accessionNumber, "0000000801-12345");
        DataElementHelper.SetDataElement(ref studyDate, DateTime.Now.ToString("yyyyMMdd"));
        DataElementHelper.SetDataElement(ref studyTime, DateTime.Now.ToString("HHmmss"));
        DataElementHelper.SetDataElement(ref studyInstanceUID, studyUID);
        DataElementHelper.SetDataElement(ref seriesInstanceUID, seriesUID);
        DataElementHelper.SetDataElement(ref mediaStorage, "1.2.840.10008.5.1.4.1.1.7");
        ds.Insert(patientID);
        ds.Insert(patientName);
        ds.Insert(accessionNumber);
        ds.Insert(studyDate);
        ds.Insert(studyTime);
        ds.Insert(studyInstanceUID);
        ds.Insert(seriesInstanceUID);
        ds.Insert(mediaStorage);

        writer.SetImage(image);
        writer.SetFileName("gdcm_test.dcm");
        bool ret = writer.Write();

答案 1 :(得分:1)

请查看最初由Colby Dillion编写的mdcm C#DICOM库。他开发了托管C ++“桥接”到IJG/LibJPEGOpenJPEG代码库,因此mdcm提供8/12/16位有损和无损JPEG支持以及JPEG-2000支持。

Colby的原始库具有WinForms依赖性。我创建了一个Silverlight和WPF目标的mdcm here分支。该库的WPF版本可以充分利用Colby最初实现的相同JPEG(-2000)编解码器 另一方面,Silverlight版本目前无法从这些编解码器中受益。我已尝试将FJCoreLibJpeg.Net库应用于Silverlight中的有损JPEG支持,但这些库目前仅支持8位图像。

的问候,
Anders @ Cureos

答案 2 :(得分:0)

.NET本身没有DICOM支持的功能。您将需要使用库。我不知道有任何免费的,但我已经使用过LeadTools,它会这样做(需要付出代价)。但我只会给它一个4/10,我会重新开始寻找其他选项。

答案 3 :(得分:0)

您无需将JPEG转换为DICOM。 DICOM只是JPEG流的“信封”。以下是我在GDCM中为封装(=放入DICOM信封)现有的MPEG2文件所做的事情:

http://gdcm.sourceforge.net/html/MpegVideoInfo_8cs-example.html

只需将该代码调整为输入JPEG文件即可。例如,看看:

http://gdcm.sourceforge.net/html/DecompressJPEGFile_8cs-example.html

无需解压缩/重新压缩,这将浪费资源。