sqlite和python ......速度与激情

Question

我在python中实现了一个从蛋白质fasta文件构建db的程序。 fasta文件是包含一些大分子序列的文本文件。您可以阅读有关here的更多信息。 从每种蛋白质我的程序生成一系列肽，它们是蛋白质片。为了我的目标，程序在SQLite中构建和查询数据库。

你知道在python中是否有很多技巧可以更快地填充或查询sqlite数据库？ 如果我使用像SQLAlchemy这样的图层或ORM，我可以提高性能吗？

Answer 1

你不会提高性能，ORM层会增加一些开销，但你可能会更容易实验。根据您的数据大小，您可以create the database in memory更快。或者您可能希望查看不同类型的数据库，例如redis。