大家好,我怎样才能将ddply函数用于线性模型:
x1 <- c(1:10, 1:10)
x2 <- c(1:5, 1:5, 1:5, 1:5)
x3 <- c(rep(1,5), rep(2,5), rep(1,5), rep(2,5))
set.seed(123)
y <- rnorm(20, 10, 3)
mydf <- data.frame(x1, x2, x3, y)
require(plyr)
ddply(mydf, mydf$x3, .fun = lm(mydf$y ~ mydf$X1 + mydf$x2))
生成此错误:
model.frame.default中的错误(公式= mydf $ y~mydf $ X1 + mydf $ x2, drop.unused.levels = TRUE): 变量'mydf $ X1'的无效类型(NULL)
感谢您的帮助。
答案 0 :(得分:28)
这是你需要做的。
mods = dlply(mydf, .(x3), lm, formula = y ~ x1 + x2)
mods是包含回归结果的两个对象的列表。你可以从mods中提取你需要的东西。例如,如果要提取系数,可以编写
coefs = ldply(mods, coef)
这会给你
x3 (Intercept) x1 x2
1 1 11.71015 -0.3193146 NA
2 2 21.83969 -1.4677690 NA
EDIT。如果你想要ANOVA
,那么你可以做到
ldply(mods, anova)
x3 Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
1 1 1 2.039237 2.039237 0.4450663 0.52345980
2 1 8 36.654982 4.581873 NA NA
3 2 1 43.086916 43.086916 4.4273907 0.06849533
4 2 8 77.855187 9.731898 NA NA
答案 1 :(得分:12)
拉姆纳特所解释的是完全正确的。但我会详细说明一下。
ddply
需要一个数据帧,然后返回一个数据帧。 lm()
函数将数据框作为输入,但返回一个线性模型对象。您可以通过?lm
:
值
lm返回类“lm”的对象或类的多个响应 c(“mlm”,“lm”)。
因此,您不能只将lm对象推送到数据框中。您可以选择将lm
的输出强制转换为数据框,也可以将lm对象推送到列表而不是数据框中。
为了说明这两个选项:
以下是将lm对象推入列表的方法(非常类似于Ramnath所说的):
outlist <- dlply(mydf, "x3", function(df) lm(y ~ x1 + x2, data=df))
另一方面,如果你只想提取系数,你可以创建一个运行回归的函数,然后只返回数据框形式的系数,如下所示:
myLm <- function( formula, df ){
lmList <- lm(formula, data=df)
lmOut <- data.frame(t(lmList$coefficients))
names(lmOut) <- c("intercept","x1coef","x2coef")
return(lmOut)
}
outDf <- ddply(mydf, "x3", function(df) myLm(y ~ x1 + x2, df))
答案 2 :(得分:1)
使用此
mods <- dlply(mydf, .(x3), lm, formula = y ~ x1 + x2)
coefs <- llply(mods, coef)
$`1`
(Intercept) x1 x2
11.7101519 -0.3193146 NA
$`2`
(Intercept) x1 x2
21.839687 -1.467769 NA
anovas <- llply(mods, anova)
$`1`
Analysis of Variance Table
Response: y
Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
x1 1 2.039 2.0392 0.4451 0.5235
Residuals 8 36.655 4.5819
$`2`
Analysis of Variance Table
Response: y
Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
x1 1 43.087 43.087 4.4274 0.0685 .
Residuals 8 77.855 9.732
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1