Question

最终我理解这一点并且有效。

bash脚本：

#!/bin/bash
#$ -V
#$ -cwd
#$ -o $HOME/sge_jobs_output/$JOB_ID.out -j y
#$ -S /bin/bash
#$ -l mem_free=4G


c=$SGE_TASK_ID
cd /home/xxx/scratch/test/
FILENAME=`head -$c testlist|tail -1`
python testpython.py $FILENAME

python脚本：

#!/bin/python
import sys,os


path='/home/xxx/scratch/test/'
name1=sys.argv[1]
job_id=os.path.join(path+name1)
f=open(job_id,'r').readlines()
print f[1]

THX

Answer 1

Bash变量实际上是环境变量。你可以通过os.environ对象获得类似字典的界面。请注意，Bash中有两种类型的变量：当前进程的本地变量，以及子进程继承的变量。您的Python脚本是子进程，因此您需要确保export您希望子进程访问的变量。

要回答原始问题，您需要先导出变量，然后使用os.environ从python脚本中访问它。

##!/bin/bash
#$ -V
#$ -cwd
#$ -o $HOME/sge_jobs_output/$JOB_ID.out -j y
#$ -S /bin/bash
#$ -l mem_free=4G

c=$SGE_TASK_ID
cd /home/xxx/scratch/test/
export FILENAME=`head -$c testlist|tail -1`
chmod +X testpython.py
./testpython.py


#!/bin/python
import sys
import os

for arg in sys.argv:  
    print arg  

f=open('/home/xxx/scratch/test/' + os.environ['FILENAME'],'r').readlines()
print f[1]

或者，您可以将变量作为命令行参数传递，这是您的代码现在正在执行的操作。在这种情况下，您必须查看sys.argv，这是传递给您的脚本的参数列表。它们在调用脚本时以与您指定的顺序相同的顺序显示在sys.argv中。 sys.argv[0]始终包含正在运行的程序的名称。后续条目包含其他参数。 len(sys.argv)表示脚本收到的参数数量。

#!/bin/python
import sys
import os

if len(sys.argv) < 2:
    print 'Usage: ' + sys.argv[0] + ' <filename>'
    sys.exit(1)

print 'This is the name of the python script: ' + sys.argv[0]
print 'This is the 1st argument:              ' + sys.argv[1]

f=open('/home/xxx/scratch/test/' + sys.argv[1],'r').readlines()
print f[1]

Answer 2

看看parsing Python arguments。你的bash代码没问题，只需要编辑你的Python脚本来获取参数。

Answer 3

脚本的命令行参数以sys.argv列表的形式提供。

Answer 4

在你的剧本中使用它（按照Aarons建议编辑）：

def main(args):
    do_something(args[0])


if __name__ == "__main__":
    import sys
    main(sys.argv[1:])

如何将Bash变量传递给Python？

4 个答案: