Question

我想逐步完成一个R脚本。我在搜索如何执行此操作时看到了“debug”命令，但这似乎只适用于函数。该脚本没有任何功能。

“浏览器”命令看起来很有前景，所以我把“browser（）”作为我脚本的第一行，但是当我运行它时似乎没有做任何事情。

如何让脚本在第一行暂停，以便逐步完成？

Answer 1

我正试图在RStudio的IDE版本0.98.1102中解决这个问题（通过一个没有特定功能的脚本来调用）。

RStudio中新脚本的解决方案：

创建新的R脚本（ctrl+shift+n）
在文件中输入代码
设置break point依据
- a）点击要设置break point（红点）或
- b）将browser()添加到您要设置break point的代码行
保存文件
进入调试模式并通过以下方式获取文件
- a）检查Source on Save框（Source窗口上方），然后保存文件，
- b）点击Source窗口右上角的Source按钮，
- c）在debugSource("<yourfilename>")中输入enter + Console或
- d）输入ctrl+shift+s
完成调试过程

有关在RStudio中调试的更多步骤，请参阅此help file （2015年4月23日12:59）。

Answer 2

我偏爱RStudio，所以我推荐以下内容：

下载RStudio
打开您的R脚本
将光标放在第一行
点击ctrl + enter（PC / Linux）或命令+ return（Mac）
重复！

RStudio的一个很好的功能是RStudio服务器可以在无头服务器上运行良好。然后，您可以通过本地计算机上的Web浏览器中的http连接到服务器。在EC2实例上运行R时，我使用此配置。 RStudio保持状态，所以如果我在火车上失去了互联网接入，当我收到信号时，RStudio准确地从我离开的地方开始，我的远程机器不知道我断开连接并重新连接。请注意，目前仅在FC / CentOS和Debian / Ubuntu上支持RStudio服务器。虽然它可以在* nix的其他变体下编译。

Answer 3

一种流行的方法是通过“IDE”或编辑器执行此操作 - Emacs / ESS做得很好，其他人也这样做。

基本思想是将游标下的行或函数或块，...发送到关联的R进程。其他几位编辑也对此表示支持，包括RStudio。我的偏好仍然是ESS，但我相信你能找到合适的东西。

最后，browser()等人可以在R进程中做到这一点，但它的点击率稍微低一点。阅读文档或Chambers“Software for Data Analysis”（Springer，2008）等书籍。

Answer 4

对于仅考虑完整表达式而不是单独行的R解决方案，请尝试以下方法：

sourcep <- function(file){
  coms <- parse(file)
  for (i in seq_along(coms)){
    print(coms[[i]])
    eval(coms[[i]],envir=.GlobalEnv)
    mess <- paste("Expression",i,"of",length(coms),"parsed. Press <return> to continue.")
    cat(mess)
    readLines(n=1)
  }
}

你打电话给这个叫source（虽然这是更基本的，不包括任何选项）。基本上，它使用parse来创建源文件中已解析但未评估的表达式的列表，然后遍历此列表以打印表达式，在全局环境中对其进行评估，然后发出消息以指示进程。最后一行是创建暂停的行：从stdin()读取单行的调用。

Answer 5

您在评论中提到您使用Rscript运行代码，但要进行调试，您需要以交互方式运行它。换句话说，要让browser进入＆＃34;工作＆＃34;，请启动常规R控制台并source您的脚本。由于脚本的第一行是browser()，因此您会立即返回提示，您可以使用＆＃34; n＆＃34;单步执行代码。但是，由于它是一个完整的R提示，您还可以通过键入其名称或分配给它来检查或更改任何变量值。（或者实际上，调用任意R函数。）

Answer 6

根据another answer的建议，在脚本开头插入browser()，通过运行R而不是Rscript来获取互动会话，然后使用{{1}如果您的脚本不需要commadline参数（例如argparse处理的那些），source('myscript.Rscript')来自{{1>}将会执行。

如果确实需要使用命令行args运行，则可以使用R选项（例如R）调用--args，并且源脚本将看到参数，就好像它有已使用Rscript调用。 the question of how to pass commandline args to source还有其他解决方案，但他们并没有针对这一特定用例，R --no-restore --no-save --args <your commandline args here>只会被调用一次。

如何从头开始单步执行R脚本？

6 个答案: