我有一个包含超过一百万列的非常大的文件。我需要在文件中添加第二，第三，第四，第五和第六列，第二列是第一列的副本，其他列在每行上包含相同的值。例如，我有一个看起来像这样的文件：
id1 A A C T ..
id2 A G T C ..
id3 G A T C ..
id4 G G T T ..
.
.
我需要将其更改为：
id1 id1 0 0 -9 -9 A A C T ..
id2 id2 0 0 -9 -9 A G T C ..
id3 id3 0 0 -9 -9 G A T C ..
id4 id4 0 0 -9 -9 G G T T ..
.
.
有关如何在Unix下高效执行此操作的任何想法（因为我需要多次重复此操作）？
答案 0 :(得分：3)
sed 's/^\([^ ]*\)/\1 \1 0 0 -9 -9/'
如果编写C ++程序的速度不够快，那只需要几行。
答案 1 :(得分：0)
我猜我们正在尝试将此文件转换为PLINK ped format，如果这样，则无需添加这些列，PLINK可以使用以下标志处理irregular files：
格式不正确的PLINK文本文件
这些文件使您可以使用缺少家庭ID的.fam或.ped文件， 父母身分，性别和/或表型栏。
--no-fid --no-parents --no-sex --no-pheno