Question

我正在进行模拟研究，需要处理并保存多个文本文件的结果。我以这样的方式组织数据，其中有子目录，并且在每个子目录中，我需要处理并获得1000个数据文件的单独结果。使用宏在SAS中很容易做到这一点。但是，我是R的新手，无法弄清楚如何做到这一点。以下是我想要完成的事情。

DATA Folder-> DC1 -> DC1R1.txt ... DC1R1000.txt
              DC2 -> DC2R1.txt ... DC2R1000.txt

非常感谢任何帮助！

Answer 1

我现在不在R附近的计算机附近，但是阅读文件相关功能的帮助：

dir函数将列出文件和目录。它有一个递归的参数。 list.files是dir的别名。 file.info函数会告诉您（除其他事项外）路径是否为目录而file.path将组合路径部分。

basename和dirname功能也可能有用。

请注意，所有这些功能都是矢量化的。

编辑现在在电脑上，所以这是一个例子：

# Make a function to process each file
processFile <- function(f) {
  df <- read.csv(f)
  # ...and do stuff...
  file.info(f)$size # dummy result
}

# Find all .csv files
files <- dir("/foo/bar/", recursive=TRUE, full.names=TRUE, pattern="\\.csv$")

# Apply the function to all files.
result <- sapply(files, processFile)

Answer 2

如果您需要对每个文件运行相同的分析，则可以使用list.files(recursive = T)一次性访问它们。这假设您已将工作目录设置为Data Folder。 recursive = T也列出了子目录中的所有文件。

Answer 3

filenames <- list.files("path/to/files", recursive=TRUE) 这将为您提供位于一个文件夹下的所有文件及其下的子文件夹。

Answer 4

您可以使用Perl的glob ()函数获取文件列表，并使用例如RSPerl的界面将其发送给R.

如何从多个目录中读取多个文件到R中进行处理？

4 个答案: