在Windows中为Cytoscape插件开发设置Eclipse

Question

首先我要说的是，我不是一位非常有经验的程序员，如果你能完全指出你可能会忽略的任何步骤，我将非常感激。

我目前正处于Cytoscape插件开发的初始阶段，我在Eclipse中创建了一个java项目并完成了以下内容

1. 我已将cytoscape.jar添加为外部库

2. 我在“程序参数”下的参数选项卡中添加了“-p C：\ Program Files \ Cytoscape_v2.8.1 \ plugins”

当我尝试运行插件时，它会加载cytoscape但没有任何已安装的插件（插件管理器中有0个插件），此外它还有缩减的菜单选项（无法导入某些文件，选项就不再存在了）

我怀疑是因为我需要包含更多jar文件作为外部库，但我不确定是哪些。

我正在使用Eclipse Indigo和Cytoscape 2.8.1。

我不认为这是插件代码的问题，因为我已经使用现有插件的源代码作为测试插件。

感谢您的耐心和时间。

Sudipto

PS：我已经看过以下内容但没有取得多大成功 http://cytoscape.wodaklab.org/wiki/SettingUpEclipseForPluginDevelopment

Answer 1

想出问题，没有注意到我的插件路径中的空间，引号解决了整个问题。

此外，您必须设置您的项目的jar文件的位置和插件。对于eclipse，这可能不是很清楚，因为eclipse的方向与netbeans的方向略有不同。

因此，如果您将jar导出到/ workspace，并且在/Applications/Cytoscape_v2.8.3（OS X）中有cytoscape，那么将以下内容作为两个单独的行放在运行配置中：

-p "/Applications/Cytoscape_v2.8.3/plugins" 
-p "/workspace/jar_file_export_folder"