Question

如何在Python中转换并保存16位单通道TIF？

我可以毫无问题地加载16位和32位图像，并看到32位图像是模式F而16位图像是模式I;16S：

import Image
i32 = Image.open('32.tif')
i16 = Image.open('16.tif')
i32
# <TiffImagePlugin.TiffImageFile image mode=F size=2000x1600 at 0x1098E5518>
i16
# <TiffImagePlugin.TiffImageFile image mode=I;16S size=2000x1600 at 0x1098B6DD0>

但是我在使用16位图像时遇到了麻烦。如果我想保存为PNG，我不能直接这样做：

i32.save('foo.png')
# IOError: cannot write mode F as PNG
i16.save('foo.png')
# ValueError: unrecognized mode

如果我转换32位图像，我可以保存它：

i32.convert('L').save('foo.png')

但是相同的命令不适用于16位图像：

i16.convert('L').save('foo.png')
# ValueError: unrecognized mode

Answer 1

偶然发现这个线程试图用PIL / numpy保存16位TIFF图像。

版本：python 2.7.1 - numpy 1.6.1 - PIL 1.1.7

这是我写的快速测试。 uint16 numpy array - ＆gt;转换为字符串 - ＆gt;转换为类型'I; 16'的PIL图像 - ＆gt;保存为16位TIFF。

在ImageJ中打开图像显示右侧水平渐变图案，图像类型为“每像素位数：16（无符号）”

import Image
import numpy

data = numpy.zeros((1024,1024),numpy.uint16)

h,w = data.shape

for i in range(h):
    data[i,:] = numpy.arange(w)

im = Image.fromstring('I;16',(w,h),data.tostring())
im.save('test_16bit.tif')

编辑：从1.1.7开始，PIL不支持编写压缩文件，但pylibtiff支持（lzw压缩）。因此测试代码变为（用pylibtiff 0.3测试）：

import Image
import numpy
from libtiff import TIFFimage

data = numpy.zeros((1024,1024),numpy.uint16)

h,w = data.shape

for i in range(w):
    data[:,i] = numpy.arange(h)

tiff = TIFFimage(data, description='')
tiff.write_file('test_16bit.tif', compression='lzw')
#flush the file to disk:
del tiff

请注意：测试代码已更改为生成垂直渐变，否则未实现压缩（请参阅警告：pylibtiff当前支持读取和写入使用TIFF条存储的图像）。

Answer 2

对于从16位灰度TIFF到PNG的无损转换，请使用PythonMagick：

from PythonMagick import Image
Image('pinei_2002300_1525_modis_ch02.tif').write("foo.png")

Answer 3

你似乎偶然发现了一个PIL错误或一个未实现的角落案例。

这是一种解决方法：

i16.mode = 'I'
i16.point(lambda i:i*(1./256)).convert('L').save('foo.png')

Answer 4

使用PIL 4.1 +

将ImageJ TIFF转换为JPEG

im = numpy.array(Image.open('my.tiff'))
image = Image.fromarray(im / numpy.amax(im) * 255)
image.save('my.jpg')

Python和16位Tiff

4 个答案: