Question

我正在使用的集群有几种主机类型 - 不同的Linux发行版/版本，一些32位，一些64位，不同版本的GCC。我知道我应该用GCC的平台特定MPI包装器编译我的程序。这个步骤对我来说或多或少都很清楚。

我的程序使用固定数量的主机，每个主机只运行1个进程。共享内存线程由TBB处理，所以基本上我只需要MPI来主机之间的工作分配。

最后一步是在所有主机上运行该程序。事实证明，这是我不确定该怎么做的部分，我的IT人员无法帮助我。

我所拥有的是主机IP地址列表（本地地址准确，如192.168.1.xxx）以及每个主机的用户名和密码。在所有主机上运行我的程序的步骤是什么，只要它是具有特定于平台的编译器的编译器并复制到每个主机中？任何帮助表示赞赏。

Answer 1

您需要对所有计算机，主机文件和所有计算机上的可执行文件进行无密码SSH访问。确保可执行文件在所有计算机上具有相同（相对）路径。

主机文件（在主机上）：

# my_hostfile 
192.168.0.205
192.168.0.208

Open MPI命令：

mpirun --hostfile my_hostfile programname

对于无密码SSH访问，在~/.ssh

下创建一个主密钥

ssh-keygen -t rsa

将主计算机中的~/.ssh/rsa.pub的（一行）内容添加到目标计算机上~/.ssh/authorized_keys2的新行中。（而不是RSA，您可以使用另一个SSH密码系统。）