数据框和is.nan()

时间:2011-08-11 18:42:09

标签: r

我正在使用sum(is.na(my.df))检查我的数据框是否包含任何按预期工作的NA,但sum(is.nan(my.df))没有按预期工作。

> my.df <- data.frame(a=c(1, 2, 3), b=c(5, NA, NaN))
> my.df
  a   b
1 1   5
2 2  NA
3 3 NaN
> is.na(my.df)
         a     b
[1,] FALSE FALSE
[2,] FALSE  TRUE
[3,] FALSE  TRUE
> is.nan(my.df)
    a     b 
FALSE FALSE 
> sum(is.na(my.df))
[1] 2
> sum(is.nan(my.df))
[1] 0
亲爱的,亲爱的。 是否存在行为不一致的原因?是因为缺乏实施,还是故意的? is.nan(my.df)的返回值表示什么?是否有充分的理由不在整个数据框架上使用is.nan()

is.na( )is.nan( )的文档中,参数类型看起来相同(尽管它们没有专门列出数据框):

is.na():x要测试的R对象:默认方法处理原子向量,列表和pairlists。 is.nan():x要测试的R对象:默认方法处理原子向量,列表和pairlists。

2 个答案:

答案 0 :(得分:18)

来自?is.nan

All elements of logical,integer and raw vectors are considered not to be NaN, and
elements of lists and pairlists are also unless the element is a length-one numeric
or complex vector whose single element is NaN.

数据框的列在技术上是“列表的元素”,因此is.nan(df)返回一个长度等于数据帧列数的向量,只有TRUE列由单个NaN元素组成:

> is.nan(data.frame(a=NaN,b=NA,c=1))
    a     b     c 
 TRUE FALSE FALSE 

如果您希望行为与is.na匹配,请使用apply

sum(apply(my.df,2,is.nan))

答案是1而不是2,因为is.nan(NA)FALSE ...

编辑:或者,您只需将数据框转换为矩阵:

 sum(is.nan(as.matrix(my.df)))

更新:此问题在提出问题后很快(两个月)发生变化,在R版本2.14(2011年10月)中:来自NEWS file

  

o is.finite(),is.infinite()和is.nan()的默认方法现在发出错误,如果它们的参数不是原子向量。

答案 1 :(得分:1)

由于某些奇怪的原因,is.nan函数不适用于列表。它为何与is.na不同的原因已经超出我的范围,并且似乎是语言设计问题。但是,有一个简单的解决方案:

df <- data.frame(a=c(1, 2, 3), b=c(5, NA, NaN)) 
df <- data.frame(sapply(df, function(x) ifelse(is.nan(x), NA, x)))
df
  a  b
1 1  5
2 2 NA
3 3 NA