Question

我正在处理带有6个字段的空格分隔文件：

Pop1 ID60776 62 C 10 62
Pop1 ID62442 13 A 2 13
Pop1 ID63614 56 C 0 
Pop1 ID67511 61 T 37 61
Pop1 ID68222 51 A 0 
Pop1 ID68407 65 C 16 65

然而，在第3和第5行中，只有5个字段。在这些情况下，字段5中的0后跟空格字符（'0'）。

我想在一行的末尾找到一个空格字符的所有实例（即\ s $），并用空格NA（即'\ sNA'）替换它，但我真的遇到了麻烦。例如，我尝试过sed：

sed s/\\s$/\\sNA/g

但它不起作用。有人可以帮助我吗？

谢谢！

Answer 1

\s不能用于替换字符串，因为它是一个类。
$可能正由shell解释。

尝试：

sed -e's/\s$/ NA/'

Answer 2

以下是awk中的几个等效解决方案：

awk '{ printf("%s", $0) } NF == 5 { printf("NA") } { printf("\n") }

和

awk '{ print $0 (NF==5 ? "NA" : "") }'

Answer 3

放置一个真实空格而不是\ s，并使用单引号（'）来避免shell执行变量替换：

sed -e 's/ $/ NA/'

Answer 4

您可以在纯bash shell中执行此操作，避免启动sed或awk进程：

while read line; do
  printf "%s" "$line"
  nbchar=${#line}
  if [ ${line:$((nbchar-1))} == " " ] ; then printf "NA"; fi
  printf "\n"
done < your_file

用特定字符串替换行尾的空格字符

4 个答案: