如何将.arff格式文件加载到matlab

Question

是否有任何包将.arff格式文件加载到matlab中？ .arff格式在Weka中用于运行机器学习算法。

Answer 1

从Weka is a Java library开始，您可以直接使用它公开的API来读取ARFF文件：

%## paths
WEKA_HOME = 'C:\Program Files\Weka-3-7';
javaaddpath([WEKA_HOME '\weka.jar']);
fName = [WEKA_HOME '\data\iris.arff'];

%## read file
loader = weka.core.converters.ArffLoader();
loader.setFile( java.io.File(fName) );
D = loader.getDataSet();
D.setClassIndex( D.numAttributes()-1 );

%## dataset
relationName = char(D.relationName);
numAttr = D.numAttributes;
numInst = D.numInstances;

%## attributes
%# attribute names
attributeNames = arrayfun(@(k) char(D.attribute(k).name), 0:numAttr-1, 'Uni',false);

%# attribute types
types = {'numeric' 'nominal' 'string' 'date' 'relational'};
attributeTypes = arrayfun(@(k) D.attribute(k-1).type, 1:numAttr);
attributeTypes = types(attributeTypes+1);

%# nominal attribute values
nominalValues = cell(numAttr,1);
for i=1:numAttr
    if strcmpi(attributeTypes{i},'nominal')
        nominalValues{i} = arrayfun(@(k) char(D.attribute(i-1).value(k-1)), 1:D.attribute(i-1).numValues, 'Uni',false);
    end
end

%## instances
data = zeros(numInst,numAttr);
for i=1:numAttr
    data(:,i) = D.attributeToDoubleArray(i-1);
end

%## visualize data
parallelcoords(data(:,1:end-1), ...
    'Group',nominalValues{end}(data(:,end)+1), ...
    'Labels',attributeNames(1:end-1))
title(relationName)

您甚至可以直接使用MATLAB的功能。一个例子：

%## classification
classifier = weka.classifiers.trees.J48();
classifier.buildClassifier( D );
fprintf('Classifier: %s %s\n%s', ...
    char(classifier.getClass().getName()), ...
    char(weka.core.Utils.joinOptions(classifier.getOptions())), ...
    char(classifier.toString()) )

输出C4.5决策树：

Classifier: weka.classifiers.trees.J48 -C 0.25 -M 2
J48 pruned tree
------------------

petalwidth <= 0.6: Iris-setosa (50.0)
petalwidth > 0.6
|   petalwidth <= 1.7
|   |   petallength <= 4.9: Iris-versicolor (48.0/1.0)
|   |   petallength > 4.9
|   |   |   petalwidth <= 1.5: Iris-virginica (3.0)
|   |   |   petalwidth > 1.5: Iris-versicolor (3.0/1.0)
|   petalwidth > 1.7: Iris-virginica (46.0/1.0)

Number of Leaves  :     5

Size of the tree :  9

Answer 2

是的，在MATLAB File Exchange上有一些用于WEKA文件的MATLAB接口，我通常使用这个：http://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/21204-matlab-weka-interface，你有一个saveARFF（）和一个loadARFF（）函数。

Answer 3

如果您只想将以“arff”格式存储的文件加载到Matlab中，并且不需要Weka的任何其他功能，只需删除“arff”文件的标题部分（那些属性定义），然后保存文件为csv格式（你应该用数值等价替换类值），然后使用Matlab的内置“csvread”函数。这样就无需找到第三方包。

Answer 4

M = importdata('filename.arff');

对于大文件来说非常慢，但它可以工作（在MATLAB 2010b中测试）

Answer 5

Searching the MATLAB Central File Exchange揭示了一些可能性。特别是Durga Lal Shrestha和Gerald Augusto Corzo Perez的结果看起来很有希望，但我还没有尝试过。

Answer 6

如果上述方法不起作用，并且需要标题信息，请在weka中加载arff文件，然后选择save as option并使用csv文件格式保存数据。