Question

我已经安装了“R版本2.13.1（2011-07-08）”，而不是“Ubuntu 10.04 - Lucid Lynx”。（我使用RStudio 0.94.92），编译我已安装的许多不同软件包所需的所有标头。我卡住了： install.packages（“RandForestGUI”）。一切顺利，直到

.....
* DONE (sciplot)
ERROR: dependency ‘rgl’ is not available for package ‘clusterSim’
* removing ‘/home/rs/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.13/clusterSim’
Warning in install.packages :
  installation of package 'clusterSim' had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘clusterSim’ is not available for package ‘RandForestGUI’
* removing ‘/home/rs/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.13/RandForestGUI’
Warning in install.packages :
  installation of package 'RandForestGUI' had non-zero exit status

我尝试： install.packages（“rgl”），但

Installing package(s) into ‘/home/rs/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.13’
(as ‘lib’ is unspecified)
provo con l'URL 'http://rm.mirror.garr.it/mirrors/CRAN/src/contrib/rgl_0.92.798.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1677772 bytes (1.6 Mb)
URL aperto
==================================================
downloaded 1.6 Mb

* installing *source* package ‘rgl’ ...
checking for gcc... gcc
checking for C compiler default output file name... a.out
checking whether the C compiler works... yes
checking whether we are cross compiling... no
….
checking for libpng-config... yes
configure: using libpng-config
configure: using libpng dynamic linkage
checking for X... no
configure: error: X11 not found but required, configure aborted.
ERROR: configuration failed for package ‘rgl’
* removing ‘/home/rs/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.13/rgl’
Warning in install.packages :
  installation of package 'rgl' had non-zero exit status

最后我尝试了： install.packages（“X11”）和

Installing package(s) into ‘/home/rs/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.13’
(as ‘lib’ is unspecified)
Warning in install.packages :
  package ‘X11’ is not available (for R version 2.13.1)

......卡住了！。

“R版本2.13.1（2011-07-08）”中是否可以有 RandForestGUI ？非常感谢Roberto Scotti

Answer 1

一些必要条件：

使用the CRAN Ubuntu repository中的R二进制文件。
如果您还没有这样做，请sudo apt-get install r-base-dev补充您的R环境以进行本地软件包安装。
然后执行sudo apt-get install r-cran-rgl，因为那是最难的OpenGL标头。

现在再次使用RForestGUI包及其他依赖项，并按包分析错误包。

Answer 2

该错误表示您没有适用于您的操作系统的相关X11标头包。这是不 R包。您需要使用Ubuntu提供的任何工具来安装它（因为它是Debian off-shoot，apt get应该可以工作，但是可能有其他优选的技术来向您的操作系统添加软件包。

R安装和管理手册建议，对于Debian，所需的相关操作系统包是xorg-dev。尝试使用Ubuntu中的软件包管理器进行安装，然后重新在R中安装 rgl 。

@Dirk Eddelbuettel毫无疑问会评论Ubuntu中有许多R包的预构建软件包，或者至少是R开发的元软件包，它将确保您拥有适用于您操作系统的所有标头软件包，以便您可以在安装时构建R包。我不使用Ubuntu或Debian，所以我无法帮助解决你的问题。

Answer 3

OS X中的clusterSim包有类似的问题。

在rstudio board上找到解决方案：

X11默认安装在较新版本的OS X上，因此我必须安装Quartz（X11的osx发行版）

在“R版本2.13.1（2011-07-08）”中安装RandForestGUI（因此为'rgl'，'X11）时出错

3 个答案: