有没有一种快速的方法来比较 R 中的两个向量列表？

Question

如果有两个表单列表

list_a <- list(c(1,2,3,4,5), c(6,7,8,9,10), c(11,12,13,14))
list_b <- list(c(1,9,3,7,5), c(2,7,13,9,10), c(1,12,5,14))

我想比较 list_a 中的元素与列表 list_b 中的元素并提取匹配元素的总和。我的意思是，我想比较如下

sum(c(1,2,3,4,5) %in% c(1,9,3,7,5)) 
sum(c(1,2,3,4,5) %in% c(2,7,13,9,10))
sum(c(1,2,3,4,5) %in% c(1,12,5,14))

sum(c(6,7,8,9,10) %in% c(1,9,3,7,5)) 
sum(c(6,7,8,9,10) %in% c(2,7,13,9,10))
sum(c(6,7,8,9,10) %in% c(1,12,5,14))

sum(c(11,12,13,14) %in% c(1,9,3,7,5)) 
sum(c(11,12,13,14) %in% c(2,7,13,9,10))
sum(c(11,12,13,14) %in% c(1,12,5,14))

我使用 sapply() 函数尝试了以下代码，输出符合预期（列映射到 list_a 中的元素，行映射到 list_b 中的元素）。但是，当列表的长度很大时，此代码太慢（想象一下 list_a 有 10000 个元素，list_b 有 10000 个元素）。

test <- sapply(list_a, function(x){
 
  out_sum <- sapply(list_b, function(y){
    
    matches <- sum(x %in% y)
    
    return(matches)
    
  })

return(out_sum)
  
})

输出

有人有想法吗？

Answer 1

您可以尝试使用 map 函数。它减少了一半以上的运行时间。

library(purrr)
out_sum <- list_b %>% map(function (y) {
  list_a %>%  map(function(x) sum(x %in% y))
})
out_matrix <- matrix(unlist(out_sum), ncol = length(list_a), byrow = TRUE)

Answer 2

另一种选择是使用 outer -

check <- function(x, y) sum(list_a[[x]] %in% list_b[[y]])
test  <- outer(seq_along(list_a), seq_along(list_b), Vectorize(check))