使用“或”条件过滤数据帧组

时间:2021-06-18 18:04:08

标签: python pandas dataframe pandas-groupby data-analysis

我正在处理这样一个数据帧:

    id        Xp_1  Xp_2   Xp_4   Xt_1  Xt_2  Xt_3  Mp_1   Mp_2  Mp_3  Mt_1  Mt_2 Mt_6
0    i24     Nan    0.27   Nan    0.45  0.20  0.25  0.27  Nan    Nan   Nan   Nan  Nan
1    i25     0.45   0.47   0.46   0.22  0.42  Nan   0.42  0.05   0.43  0.12  0.01  0.04
2    i11     Nan    Nan    0.32   0.14  0.32  0.35  0.29  0.33   Nan   Nan   0.02  0.44
3    i47     Nan    0.56   0.59   0.92  Nan   0.56  0.51  0.12   Nan   0.1   0.1   Nan

如您所见,我有两个宏组(X 和 M),每个宏组有两个子集(p 和 t)。我想实现的是两个宏组之间的“或”条件和宏组的每个子集之间的“与”条件。

基本上,我想保留那些在至少一个组中为每个子集至少有两个值的行。 例如: i24应该舍弃,其实我们Xps只有一个值,而且M组没有任何值。 像i11这样的条目应该保留,实际上X组不满足条件,但M满足。i25也是如此,这两个组都满足条件。

我试过了:

keep_r = (df.groupby(lambda col: col.split("_", maxsplit=1)[0], axis=1)
            .count()
            .ge(2)
            .all(axis=1))
df = df.loc[keep_r]

但它会检查所有子集(Xp、Xt、Mp、Mt)中是否至少有两个值。相反,我想独立处理 X 和 M。

谢谢!

2 个答案:

答案 0 :(得分:3)

我们可以对 2 个东西进行分组:XMpt,它们是列名的第一个和第二个字符。然后我们可以在 .count().ge(2).all(axis=1)p 的级别上调用您的 t 逻辑。然后我们通过 any:

放置 or 条件
# to keep the `id` column aside
df = df.set_index("id")

# groups
c = df.columns
g = df.groupby([c.str[0], c.str[1]], axis=1)

# boolean mask
mask = (g.count()
         .ge(2)
         .all(axis=1, level=0)     # micros: and
         .any(axis=1))             # macros: or

# new df
ndf = df[mask]

得到

>>> ndf

     Xp_1  Xp_2  Xp_4  Xt_1  Xt_2  Xt_3  Mp_1  Mp_2  Mp_3  Mt_1  Mt_2  Mt_6
id
i25  0.45  0.47  0.46  0.22  0.42   NaN  0.42  0.05  0.43  0.12  0.01  0.04
i11   NaN   NaN  0.32  0.14  0.32  0.35  0.29  0.33   NaN   NaN  0.02  0.44
i47   NaN  0.56  0.59  0.92   NaN  0.56  0.51  0.12   NaN   0.1   0.1   NaN

为了说明,在调用 allany 之前,我们有:

>>> g.count().ge(2)

         M             X
         p      t      p     t
id
i24  False  False  False  True
i25   True   True   True  True
i11   True   True  False  True
i47   True   True   True  True

然后 all 超过 0 级,即超过 p, t逻辑减少了这一步:

>>> g.count().ge(2).all(axis=1, level=0)

         M      X
id
i24  False  False
i25   True   True
i11   True  False
i47   True   True

最后 any 在剩余的 M, X 上将其减少为带有 or 逻辑的布尔系列,这表示要保留哪些行:

>>> g.count().ge(2).all(axis=1, level=0).any(axis=1)

id
i24    False
i25     True
i11     True
i47     True
dtype: bool

答案 1 :(得分:1)

IIUC 尝试从模式 MultiIndex 创建一个 str.extract

df = df.set_index('id')
df.columns = pd.MultiIndex.from_frame(df.columns.str.extract('(.)(.)_(.+)'))
0       X                                   M                              
1       p                 t                 p                 t            
2       1     2     4     1     2     3     1     2     3     1     2     6
id                                                                         
i24   NaN  0.27   NaN  0.45  0.20  0.25  0.27   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN
i25  0.45  0.47  0.46  0.22  0.42   NaN  0.42  0.05  0.43  0.12  0.01  0.04
i11   NaN   NaN  0.32  0.14  0.32  0.35  0.29  0.33   NaN   NaN  0.02  0.44
i47   NaN  0.56  0.59  0.92   NaN  0.56  0.51  0.12   NaN  0.10  0.10   NaN

然后分组级别 01 进行计数,然后将单独的逻辑应用于每个级别。:

keep = (
    df.groupby(axis=1, level=[0, 1]).count()
        .ge(2).all(axis=1, level=0).any(axis=1)
)
id
i24    False
i25     True
i11     True
i47     True
dtype: bool

然后过滤并折叠 MultiIndex:

df = df.loc[keep]
df.columns = df.columns.map(lambda c: f'{"".join(c[:-1])}_{c[-1]}')
df = df.reset_index()
    id  Xp_1  Xp_2  Xp_4  Xt_1  Xt_2  Xt_3  Mp_1  Mp_2  Mp_3  Mt_1  Mt_2  Mt_6
0  i25  0.45  0.47  0.46  0.22  0.42   NaN  0.42  0.05  0.43  0.12  0.01  0.04
1  i11   NaN   NaN  0.32  0.14  0.32  0.35  0.29  0.33   NaN   NaN  0.02  0.44
2  i47   NaN  0.56  0.59  0.92   NaN  0.56  0.51  0.12   NaN  0.10  0.10   NaN