我有一个文件夹，其中包含大约 191 个 GeoTIFF 文件（每个文件都是更大区域的不同 DEM（高程）图块）。我想将所有图块合并到一个光栅文件中。我正在使用 terra 包并且能够成功加载每个栅格并将它们从 2 米分辨率聚合到 30 米分辨率。但是，当运行 mosaic 函数将它们全部合并时，我遇到了错误（请参阅下面的错误消息）。我已经能够在只有三个图块的较小子集上运行马赛克功能，但是当我放大到所有文件时，这就会成为一个问题。
通过调用栅格摘要（见下文），聚合确实稍微改变了范围 - 这可能是问题吗？ resample 可能是一种选择，但每个单独的栅格都有不同的范围，我不确定如何实施此修复。
不确定样本数据集会有所帮助，因为我知道这些函数有效。我在高性能集群上运行此代码，因此运行小批量代码效率不高。
library(terra)
files <- as.list(list.files("./DEM_tiles", full.names = TRUE))
raster.list <- lapply(files, rast)
for(i in 1:length(raster.list)){
raster.list[[i]] <- aggregate(raster.list[[i]], fact = 15)
}
raster.mosaic <- do.call(mosaic, raster.list)
> Error: [mosaic] internal error: extents do not match ()
> Execution halted
下面是两个图块的示例：
### Before Aggregation
[[1]]
class : SpatRaster
dimensions : 25000, 25000, 1 (nrow, ncol, nlyr)
resolution : 2, 2 (x, y)
extent : -1800000, -1750000, -6e+05, -550000 (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=stere +lat_0=90 +lat_ts=70 +lon_0=-45 +x_0=0 +y_0=0 +datum=WGS84 +units=m +no_defs
source : 35_23_1_1_2m_v3.0_reg_dem.tif
name : 35_23_1_1_2m_v3.0_reg_dem
[[2]]
class : SpatRaster
dimensions : 25000, 25000, 1 (nrow, ncol, nlyr)
resolution : 2, 2 (x, y)
extent : -1800000, -1750000, -550000, -5e+05 (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=stere +lat_0=90 +lat_ts=70 +lon_0=-45 +x_0=0 +y_0=0 +datum=WGS84 +units=m +no_defs
source : 35_23_1_2_2m_v3.0_reg_dem.tif
name : 35_23_1_2_2m_v3.0_reg_dem
### After Aggregation
[[1]]
class : SpatRaster
dimensions : 1667, 1667, 1 (nrow, ncol, nlyr)
resolution : 30, 30 (x, y)
extent : -1800000, -1749990, -600010, -550000 (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=stere +lat_0=90 +lat_ts=70 +lon_0=-45 +x_0=0 +y_0=0 +datum=WGS84 +units=m +no_defs
source : memory
name : 35_23_1_1_2m_v3.0_reg_dem
min value : -15.62178
max value : 233.6489
[[2]]
class : SpatRaster
dimensions : 1667, 1667, 1 (nrow, ncol, nlyr)
resolution : 30, 30 (x, y)
extent : -1800000, -1749990, -550010, -5e+05 (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=stere +lat_0=90 +lat_ts=70 +lon_0=-45 +x_0=0 +y_0=0 +datum=WGS84 +units=m +no_defs
source : memory
name : 35_23_1_2_2m_v3.0_reg_dem
min value : -15.27713
max value : 243.0772
答案 0 :(得分：2)
我可以复制这样的消息
library(terra)
r1 <- rast(nrow=1667, ncol=1667, ext=c(-1800000, -1749990, -600010, -550000))
r2 <- rast(nrow=1667, ncol=1667, ext=c(-1800000, -1749990, -550010, -5e+05))
values(r1) <- 1:ncell(r1)
values(r2) <- 1:ncell(r2)
m <- mosaic(r1, r2)
#Error: [mosaic] internal error: extents do not match ()
而且 merge 也失败了。这是一个我会调查的错误。它适用于 raster
library(raster)
x1 <- raster(r1)
x2 <- raster(r2)
m <- mosaic(x1, x2, fun=mean)
mm <- merge(x1, x2)
稍后：
错误是因为栅格未对齐。使用 terra 1.2-1（目前为 development version），我现在得到
library(terra)
#terra version 1.2.1
crs <- "+proj=stere +lat_0=90 +lat_ts=70 +lon_0=-45 +x_0=0 +y_0=0 +datum=WGS84 +units=m"
r1 <- rast(nrow=1667, ncol=1667, ext=c(-1800000, -1749990, -600010, -550000), crs=crs)
r2 <- rast(nrow=1667, ncol=1667, ext=c(-1800000, -1749990, -550010, -5e+05), crs=crs)
values(r1) <- 1:ncell(r1)
values(r2) <- 1:ncell(r2)
m <- mosaic(r1, r2)
#Warning message:
#[mosaic] rasters did not align and were resampled
m
#class : SpatRaster
#dimensions : 3334, 1667, 1 (nrow, ncol, nlyr)
#resolution : 30, 30 (x, y)
#extent : -1800000, -1749990, -600010, -499990 (xmin, xmax, ymin, ymax)
#coord. ref. : +proj=stere +lat_0=90 +lat_ts=70 +lon_0=-45 +x_0=0 +y_0=0 +datum=WGS84 +units=m +no_defs
#source : memory
#name : lyr.1
#min value : 1
#max value : 2778889
还有
@Elia 的建议是一个很好的解决方法：
r1 <- writeRaster(r1, "test1.tif", overwrite=TRUE)
r2 <- writeRaster(r2, "test2.tif", overwrite=TRUE)
v <- vrt(c("test1.tif", "test2.tif"), "test.vrt", overwrite=TRUE)
v
#class : SpatRaster
#dimensions : 3334, 1667, 1 (nrow, ncol, nlyr)
#resolution : 30, 30 (x, y)
#extent : -1800000, -1749990, -600020, -5e+05 (xmin, xmax, ymin, ymax)
#coord. ref. : +proj=stere +lat_0=90 +lat_ts=70 +lon_0=-45 +x_0=0 +y_0=0 +datum=WGS84 +units=m +no_defs
#source : test.vrt
#name : test
#min value : 1
#max value : 2778889