如何在 R 中对 raitos（两对数据）进行 t 检验？

Question

我有一个五列的数据框，如下所示：

我想对 A2/A1 与 B2/B1 进行 t 检验。我能想到的一种方法是首先计算比率并创建一个新列 C=A2/A1 和 D=B2/B1。然后对 C 与 D 进行 t 检验。但这是正确的方法吗？或者是否有其他方法可以使用原始数据进行比较？ 谢谢！

Answer 1

这将执行配对 t 检验。

text="Gene A1 A2 B1 B2
gene1 100 20 2 20
gene2 10 200 2 200
gene3 10 2 2 2"
df=read.table(text=text, header=TRUE)
df[,"C"]=df[,"A2"]/df[,"A1"]
df[,"D"]=df[,"B2"]/df[,"B1"]
t.test(df[,"C"], df[,"D"], paired=TRUE)