我有5x14数据矩阵。我正在使用MDS来获取感知图。我可以正确地做MDS＆amp;得到结果。
但我的问题是在MDS中我们可以映射行或列变量。可以映射行和放大器吗？使用MDS的列变量。
我使用的代码如下：
perp<-read.csv("E:\\Projects\\Combined_3.csv")
ads.dis<-dist(perp)
perp_mds <- cmdscale(ads.dis, k = 2,eig=TRUE)
x <- perp_mds$points[,1]
y <- perp_mds$points[,2]
plot(x,y, xlab = "Coordinate 1", ylab = "Coordinate 2", type = "n")
text(x,y, labels = rownames(perp))
如果有人可以帮我编码，我将不胜感激。
此致 ARI
答案 0 :(得分：5)
一般来说，答案是否定的，而不是cmdscale()。所有cmdscale()都知道的是对象之间的差异。在素食主义包中，有一个函数capscale()，它是主坐标分析的约束版本（PCoA又名MDS），但可以用于普通的PCoA。它可以将对象和变量放在类似双标图的图中：
require(vegan)
data(varespec)
mod <- capscale(varespec ~ 1)
plot(mod)
但请注意，欧洲距离的PCoA与PCA相同，也可以使用，并自然地绘制对象和变量：
plot(rda(varespec))
或使用基本R函数
mod2 <- prcomp(varespec)
biplot(mod2)
或者您的意思是MDS的非度量版本？